RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 RAB36O95755 333 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 OPN1SWP03999 348 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 THY1P04216 161 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 IFNGR1P15260 489 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 CD247P20963 164 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 PCGF2P35227 344 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 BIDP55957 195 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 RPS23P62266 143 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 RIN1Q13671 783 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 FXNQ16595 210 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 RASSF5Q8WWW0 418 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 CHODLQ9H9P2 273 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 NANSQ9NR45 359 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R5Q9NYW4 299 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF229Q9UJW7 825 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 TRAPPC13A5PLN9 417 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 M0R233 179 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 LILRA1O75019 489 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 OR6A2O95222 327 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 VIMP08670 466 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 ADRA2AP08913 450 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 RAB1AP62820 205 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 PIGFQ07326 219 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 NFYCQ13952 458 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 METTL21CQ5VZV1 264 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 UGT2A3Q6UWM9 527 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35D2Q76EJ3 337 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC80Q76M96 950 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 OR4D11Q8NGI4 311 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 UBASH3BQ8TF42 649 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf159Q96HA4 380 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 MS4A5Q9H3V2 200 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 GLTPQ9NZD2 209 aa18.08■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf98E9PRG8 122 aa18.07■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 TGFAP01135 160 aa18.07■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 ASAH2BP0C7U1 165 aa18.07■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 GIPRP48546 466 aa18.07■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 MSMPQ1L6U9 139 aa18.07■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 NRN1LQ496H8 165 aa18.07■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF566Q969W8 418 aa18.07■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 TAMM41Q96BW9 452 aa18.07■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SOX7Q9BT81 388 aa18.07■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SLC7A8Q9UHI5 535 aa18.07■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SLC7A7Q9UM01 511 aa18.07■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 ANK2Q01484 3957 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SH3PXD2BA1X283 911 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 LRP5LA4QPB2 252 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 EDF1O60869 148 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINI2O75830 405 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 CH25HO95992 272 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINA5P05154 406 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 PGA4P0DJD7 388 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 PGA3P0DJD8 388 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 GZMMP51124 257 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 GALK2Q01415 458 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 VMACQ2NL98 169 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 REP15Q6BDI9 236 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 DPPA2Q7Z7J5 298 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF584Q8IVC4 421 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A24Q8N4F4 322 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 VIPAS39Q9H9C1 493 aa18.06■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 RNF13O43567 381 aa18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 IGF2P01344 180 aa18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 OR8G3PP0DMU2 310 aa18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 CRYBA2P53672 197 aa18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SKA3Q8IX90 412 aa18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 OR10A6Q8NH74 314 aa18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SLC26A7Q8TE54 656 aa18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS27Q9BQR3 290 aa18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 TPK1Q9H3S4 243 aa18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 NPHS2Q9NP85 383 aa18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 MRGBPQ9NV56 204 aa18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM38BQ9NVV0 291 aa18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 REV1Q9UBZ9 1251 aa18.05■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 CENPBD1B2RD01 187 aa18.04■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 APEX1P27695 318 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 LSP1P33241 339 aa18.04■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 RAB39AQ14964 217 aa18.04■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 HIST3H3Q16695 136 aa18.04■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 CR1LQ2VPA4 569 aa18.04■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 LRFN4Q6PJG9 635 aa18.04■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 IL17RELQ6ZVW7 336 aa18.04■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC17Q8N6Y2 441 aa18.04■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01356Q8N9X3 169 aa18.04■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
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