RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 ACSM1Q08AH1 577 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MYBPHQ13203 477 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 AQP6Q13520 282 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TPBGQ13641 420 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TOMM20Q15388 145 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ACKR1Q16570 336 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MESTQ5EB52 335 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OR2G6Q5TZ20 316 aa5.96□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 DNM1P34Q6PK57 102 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 C19orf48Q6RUI8 117 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 B3GLCTQ6Y288 498 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 HDDC2Q7Z4H3 204 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MDGA2Q7Z553 956 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PXKQ7Z7A4 578 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MARCH9Q86YJ5 346 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.96□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 OR6K6Q8NGW6 343 aa5.96□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 THAP4Q8WY91 577 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PSMF1Q92530 271 aa5.96□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 ARL5BQ96KC2 179 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 GNRHR2Q96P88 292 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 DDOQ99489 341 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MNTQ99583 582 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TBX5Q99593 518 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 NPAS1Q99742 590 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ALG12Q9BV10 488 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ALG8Q9BVK2 526 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OR51E2Q9H255 320 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PROK2Q9HC23 129 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ASCL3Q9NQ33 180 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ASB6Q9NWX5 421 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 NDUFB11Q9NX14 153 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 LRFN1Q9P244 771 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 B4GALT7Q9UBV7 327 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 STUB1Q9UNE7 303 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SSR3Q9UNL2 185 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TRAPPC4Q9Y296 219 aa5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 UNC13CQ8NB66 2214 aa5.96□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 PRSS37A4D1T9 235 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ARGFXA6NJG6 315 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 CENPBD1B2RD01 187 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MS4A18H0YCH9 400 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 LINC01387J3KSC0 135 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 J3QLW9 94 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 J3QW42 95 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SULT2B1O00204 365 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TM4SF5O14894 197 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZIC3O60481 467 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 FZD7O75084 574 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TRAPPC6AO75865 159 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TPPPO94811 219 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 AKR7A3O95154 331 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PMS2P2O95744 297 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 HLA-DPB1P04440 258 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ADRB1P08588 477 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF19P17023 458 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 IL11P20809 199 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PYCR1P32322 319 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SFTPDP35247 375 aa5.95□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 DNASE1L1P49184 302 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SOX8P57073 446 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 HSF1Q00613 529 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 GPR50Q13585 617 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TGIF1Q15583 401 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OR1C1Q15619 314 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SSX1Q16384 188 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MS4A18Q3C1V0 323 aa5.95□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 NUP210LQ5VU65 1888 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TMPPEQ6ZT21 453 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SLC35D2Q76EJ3 337 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SLC16A9Q7RTY1 509 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ATCAYQ86WG3 371 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KLBQ86Z14 1044 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 UEVLDQ8IX04 471 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PHC2Q8IXK0 858 aa5.95□□□□□ -1.46
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