RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403915.5

KCNS3-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS3, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3-202ENST00000403915 TFPIP10646 304 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 COL9A1P20849 921 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 FPR2P25090 351 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 GAS1P54826 345 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 DLK1P80370 383 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 DOC2BQ14184 412 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 STT3BQ8TCJ2 826 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 SEMA4DQ92854 862 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 RASD2Q96D21 266 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 ZNF75AQ96N20 296 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 CDCA4Q9BXL8 241 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 OR8D2Q9GZM6 311 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 TJP1Q07157 1748 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 UBE2QL1A1L167 161 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 GJE1A6NN92 205 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 E5RGE8 158 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 SLC16A5O15375 505 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 WDR1O75083 606 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 OR5AC1P0C628 307 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 SULT1A1P50225 295 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 MMP16P51512 607 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 CDH12P55289 794 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 SH3BP2P78314 561 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 ZNF763Q0D2J5 394 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 UGCGQ16739 394 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 IQCJQ1A5X6 159 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 CARD16Q5EG05 197 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 RAD18Q9NS91 495 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 A0A1W2PPV4 95 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 PPIAL4DF5H284 164 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 CORTO00230 105 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 WNT9AO14904 365 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 VIPP01282 170 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 CNR2P34972 360 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 TIMP3P35625 211 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 S100A10P60903 97 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 CDC42P60953 191 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 TIMM10P62072 90 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 ALKBH6Q3KRA9 238 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 C22orf42Q6IC83 251 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 ZNF738Q8NE65 137 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 SLC46A1Q96NT5 459 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 PRAP1Q96NZ9 151 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 SEMA3CQ99985 751 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 TMEM27Q9HBJ8 222 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 SERHLQ9NQF3 203 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 KPTNQ9Y664 436 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.48□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.48□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 C9JVG2 144 aa8.48□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 MFNGO00587 321 aa8.48□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 GRM6O15303 877 aa8.48□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 FBXO24O75426 580 aa8.48□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 METTL18O95568 372 aa8.48□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 IGSF6O95976 241 aa8.48□□□□□ -1.05
KCNS3-202ENST00000403915 OR5G3P0C626 314 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms