RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNLZQ5SXM8 178 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 HES5Q5TA89 166 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00173Q6ZV60 143 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 STRADAQ7RTN6 431 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM69Q86WT6 500 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ECHDC2Q86YB7 292 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUDCD3Q8IVD9 361 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 MREGQ8N565 214 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM133AQ8N9E0 248 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFSD9Q8NBP5 474 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR52P1PQ8NH57 321 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 SGK3Q96BR1 496 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSGA13Q96PP4 275 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 OSBPL11Q9BXB4 747 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ULBP2Q9BZM5 246 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAP2Q9NPF8 381 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMOXQ9NWM0 555 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIVEP2P31629 2446 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GVX0 72 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 H0YHG0 523 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 K7EQM0 130 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV1-8P0DP01 117 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV1-13P0DP09 117 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC2A5P22732 501 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCR8P51685 355 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYCNQ0VAF6 134 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCRN3Q0VDG4 424 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERCC8Q13216 396 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 FILIP1LQ4L180 1135 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 SFT2D3Q587I9 215 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 VAX1Q5SQQ9 334 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR9Q5T870 116 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 BIVMQ86UB2 503 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 RIMKLAQ8IXN7 391 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 STPG2Q8N412 459 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2T3Q8NH03 318 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC25Q96NG3 672 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC38A2Q96QD8 506 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF607Q96SK3 696 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHAC1Q9BUX1 264 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 OSBPL10Q9BXB5 764 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPNS1Q9H2V7 528 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCCC2Q9HCC0 563 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNRD1Q9P1U0 126 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX6Q9UNH7 406 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFNGQ9Y644 331 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR179Q6PRD1 2367 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GVI7 797 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 KMOO15229 486 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEB3O15480 346 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 RRP8O43159 456 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 MGRN1O60291 552 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHOBTB1O94844 696 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPZL1O95297 269 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAPN1P07384 714 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLR2MP0CAP2 368 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 OPRD1P41143 372 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAMPTP43490 491 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS21P63220 83 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDK16Q00536 496 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRPSAP1Q14558 356 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 DGUOKQ16854 277 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 XKR4Q5GH76 650 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4F3Q6IEY1 312 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM40Q6P9F5 258 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 CALHM3Q86XJ0 350 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCT7Q99832 543 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERP44Q9BS26 406 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 PARD6BQ9BYG5 372 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 BLOC1S6Q9UL45 172 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNPLA6Q8IY17 1366 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa1.55□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0B4J2A0 478 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM223A0PJW6 202 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAD51BO15315 384 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 GABARAPO95166 117 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV4-1P06312 121 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00869P0C866 280 aa1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms