RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SEC14L2O76054 403 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 UBOX5O94941 541 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 LYPD3O95274 346 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 LY6G6DO95868 133 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 THY1P04216 161 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ADORA3P0DMS8 318 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HLA-DOBP13765 273 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF1BP20333 461 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 AHCYP23526 432 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TTKP33981 857 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ACVR1BP36896 505 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TUBA1BP68363 451 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TUBA4AP68366 448 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TNK1Q13470 666 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 GK3PQ14409 553 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CARD17Q5XLA6 110 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF544Q6NX49 715 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 DEF8Q6ZN54 512 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC121Q6ZUS5 278 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TUBA1AQ71U36 451 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 DHFR2Q86XF0 187 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OR5J2Q8NH18 312 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ASB9Q96DX5 294 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PYURFQ96I23 114 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF347Q96SE7 839 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 EMC6Q9BV81 110 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 YY1AP1Q9H869 796 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CRLF2Q9HC73 371 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MED29Q9NX70 200 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 USP22Q9UPT9 525 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MOKQ9UQ07 419 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ATRQ13535 2644 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 DNHD1Q96M86 4753 aa6.68□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35F4A4IF30 521 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf98E9PRG8 122 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OR6A2O95222 327 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CH25HO95992 272 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CRYAAP02489 173 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2ABP04908 130 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CECR9P0C854 216 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RHCEP18577 417 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PAX7P23759 505 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 IFNGR2P38484 337 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CAPZA2P47755 286 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NUDT6P53370 316 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 BNIP1Q12981 228 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CAMK2DQ13557 499 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TRAM2Q15035 370 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF74Q16587 644 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OCLNQ16625 522 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 LCN8Q6JVE9 175 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RRM2BQ7LG56 351 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PXKQ7Z7A4 578 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 CDK20Q8IZL9 346 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00471Q8N535 108 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RNF148Q8N7C7 305 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 THTPAQ9BU02 230 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.67□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms