RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 C22orf42Q6IC83 251 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 PLCZ1Q86YW0 608 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ACBD7Q8N6N7 88 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 OR5J2Q8NH18 312 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 C4orf36Q96KX1 117 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 WDR76Q9H967 626 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 FKRPQ9H9S5 495 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF229Q9UJW7 825 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 POLHQ9Y253 713 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 MS4A18H0YCH9 400 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 PLPP3O14495 311 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 HPP00738 406 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 HLA-DQA2P01906 255 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 PSKH1P11801 424 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 IFNGR1P15260 489 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 SDHAP31040 664 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 CD96P40200 585 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF85Q03923 595 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 TLE3Q04726 772 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 PON3Q15166 354 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 MS4A18Q3C1V0 323 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 CARD17Q5XLA6 110 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 MISPQ8IVT2 679 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 GID4Q8IVV7 300 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 OR1J4Q8NGS1 313 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 OR13C5Q8NGS8 318 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 HPS1Q92902 700 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 DDOQ99489 341 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ASPNQ9BXN1 380 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 SP140LQ9H930 580 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa9.87□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 CD8B2A6NJW9 211 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 FTCDNL1E5RQL4 147 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 J3QRE1 110 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 SEC14L5O43304 696 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 SERPINA7P05543 415 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 CD8BP10966 210 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 MAGEB1P43366 347 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 P2RX3P56373 397 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 OR2B6P58173 313 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 BPIFB3P59826 476 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 SLC3A1Q07837 685 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ST8SIA1Q92185 356 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 NXPE2Q96DL1 559 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ALG12Q9BV10 488 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 LRFN1Q9P244 771 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 CSAG2Q9Y5P2 127 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1B0GTH9 108 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 SLC22A31A6NKX4 558 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ZNHIT1O43257 154 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ZIC3O60481 467 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 CELA3AP09093 270 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ODF4Q2M2E3 257 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 FAM27D1Q5T7N8 215 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ARL9Q6T311 187 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 RNF138Q8WVD3 245 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 KCNS3Q9BQ31 491 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 DKKL1Q9UK85 242 aa9.86□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 OR2M5A3KFT3 312 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 DOK2O60496 412 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 SLC16A7O60669 478 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 RPP14O95059 124 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 WDPCPO95876 746 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 IGHA1P01876 353 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 P04436 131 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 NBL1P41271 181 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 CRYBB2P43320 205 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 CYB561P49447 251 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 SLC35D2Q76EJ3 337 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 GLRX5Q86SX6 157 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 KLHL36Q8N4N3 616 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 NSMAFQ92636 917 aa9.85□□□□□ -0.83
GGPS1-201ENST00000282841 ORAI1Q96D31 301 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms