RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 OR4K13Q8NH42 304 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 DCUN1D4Q92564 292 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 SLC35A4Q96G79 324 aa6.59□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 MICU1Q9BPX6 476 aa6.59□□□□□ -1.35
CSDE1-201ENST00000261443 LGR4Q9BXB1 951 aa6.59□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.59□□□□□ -1.35
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CSDE1-201ENST00000261443 ZNF383Q8NA42 475 aa6.59□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 GPR174Q9BXC1 333 aa6.59□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.59□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 Q9Y3F1 56 aa6.59□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 A0A1W2PPH5 198 aa6.58□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 I3L1I5 382 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 CSN2P05814 226 aa6.58□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 ACKR3P25106 362 aa6.58□□□□□ -1.36
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