RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608263.5

CTCFL-216, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 4,040 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-216ENST00000608263 A0A1B0GV50 99 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 CCSO14618 274 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 SC5DO75845 299 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 SCGB1D2O95969 90 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 HCKP08631 526 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF20P17024 532 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 GABRG2P18507 467 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 CDK2P24941 298 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 CAMK2BQ13554 666 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 AGBL4Q5VU57 503 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 VASNQ6EMK4 673 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 PMM1Q92871 262 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 MARVELD1Q9BSK0 173 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 GSX2Q9BZM3 304 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 OBP2AQ9NY56 170 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 FITM1A5D6W6 292 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 RGS13O14921 159 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 GPANK1O95872 356 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 BTG1P62324 171 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 CD276Q5ZPR3 534 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 KIRREL2Q6UWL6 708 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 BTN2A1Q7KYR7 527 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 ZAR1Q86SH2 424 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 SIGLEC11Q96RL6 698 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 LHX9Q9NQ69 397 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 B3GNT2Q9NY97 397 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 SCN4AP35499 1836 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 AGPAT2O15120 278 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 MOSPD3O75425 235 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 EML2O95834 649 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 CCNOP22674 350 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 LIMS1P48059 325 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 DLX5P56178 289 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 CXADRP78310 365 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 SSX6Q7RTT6 188 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 OR51S1Q8NGJ8 323 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 OR13C3Q8NGS6 347 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 PTP4A1Q93096 173 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 KLHL15Q96M94 604 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 EMC7Q9NPA0 242 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 INPP5EQ9NRR6 644 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.5□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 A0A1W2PPV9 198 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF878C9JN71 531 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 IMPA2O14732 288 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 GMDSO60547 372 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 PRAMEF2O60811 474 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 SFTPBP07988 381 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 H2BFMP0C1H6 154 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF28P17035 718 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 HSD11B1P28845 292 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 DRD3P35462 400 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 CCR9P51686 369 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 RIDAP52758 137 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 EMP2P54851 167 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 DUSP8Q13202 625 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 FAM69AQ5T7M9 428 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 TMEM151BQ8IW70 566 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 CCDC36Q8IYA8 594 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 PELI1Q96FA3 418 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 INTS14Q96SY0 518 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 BCL2L14Q9BZR8 327 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 PRODH2Q9UF12 536 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 WDR90Q96KV7 1748 aa9.49□□□□□ -0.89
CTCFL-216ENST00000608263 A0A0J9YY10 115 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms