RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAJA3Q96EY1 480 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 TM9SF2Q99805 663 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 RASSF4Q9H2L5 321 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 SIGLEC7Q9Y286 467 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-214ENST00000592483 PLPP3O14495 311 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 GOSR1O95249 250 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PRKACGP22612 351 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 P2RY4P51582 365 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ALDH3A2P51648 485 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC16A1P53985 500 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PUDPQ08623 228 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 KDM4DQ6B0I6 523 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 P4HA3Q7Z4N8 544 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC17Q8N6Y2 441 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 OR13C2Q8NGS9 318 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFP3Q96NJ6 502 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIB1Q96RU8 372 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 GPA33Q99795 319 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 VCXQ9H320 206 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 VCX3BQ9H321 246 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF122Q9H9V4 155 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHL9Q9P2J3 617 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ORC6Q9Y5N6 252 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 TUBAL3A6NHL2 446 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PTP4A3O75365 173 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 NDUFB2O95178 105 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ADORA3P0DMS8 318 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ASCL1P50553 236 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 DAPP51397 102 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 RFX4Q33E94 735 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM225Q6GV28 225 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 SMARCD3Q6STE5 483 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF620Q6ZNG0 422 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PXKQ7Z7A4 578 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PHC2Q8IXK0 858 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 CBR4Q8N4T8 237 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKK1Q8NFD2 765 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 FNDC9Q8TBE3 224 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 OXGR1Q96P68 337 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT84Q9NSB2 600 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 CDH10Q9Y6N8 788 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 NPIPB13A6NJU9 1138 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 HSPB2A8KAH6 182 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 NPIPB4C9JG80 1138 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PDLIM1O00151 329 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR171O14626 319 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 EI24O14681 340 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 CRLF1O75462 422 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ALPLP05186 524 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 POU2F1P14859 743 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 IGFBP5P24593 272 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 RAD23AP54725 363 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 HSPB2Q16082 182 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP4R4Q6NUP7 873 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 OR51A7Q8NH64 312 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 FANK1Q8TC84 345 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ROBO4Q8WZ75 1007 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 TAS2R5Q9NYW4 299 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 IL20Q9NYY1 176 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 EMC3Q9P0I2 261 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 SONP18583 2426 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAV27A0A087WT01 109 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 CRHP06850 196 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 OSMP13725 252 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC6A6P31641 620 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 TIMP3P35625 211 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 FHL1Q13642 323 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 ALG10Q5BKT4 473 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHL17Q6TDP4 642 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 PRSS57Q6UWY2 283 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 OR52L1Q8NGH7 329 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 Q96MF0 132 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 RDH12Q96NR8 316 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 SMURF2Q9HAU4 748 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-214ENST00000592483 BCO1Q9HAY6 547 aa20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms