RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, human

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTIF-208	ENST00000590422	ARR3	P36575	388 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	CAPZA2	P47755	286 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	FADD	Q13158	208 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	RIN1	Q13671	783 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ADRM1	Q16186	407 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF786	Q8N393	782 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	TXNDC15	Q96J42	360 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF75A	Q96N20	296 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	C12orf10	Q9HB07	376 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422		A0A087WUJ7	227 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	C5orf58	C9J3I9	102 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	LRRN3	E7EW58	273 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	OR2T1	O43869	369 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	BGLAP	P02818	100 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ADRA2A	P08913	450 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ETS2	P15036	469 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	B4GALT1	P15291	398 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	NR4A1	P22736	598 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	AQP1	P29972	269 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	CHN2	P52757	468 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	CCNI	Q14094	377 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	DAG1	Q14118	895 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	UEVLD	Q8IX04	471 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	SPDL1	Q96EA4	605 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	VAPA	Q9P0L0	249 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	USP22	Q9UPT9	525 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422		A0A0B4J2E0	115 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422		A0A1B0GX12	115 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	CD79A	P11912	226 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	COX4I1	P13073	169 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF35	P13682	527 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	CDH15	P55291	814 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	CDK6	Q00534	326 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	PIGF	Q07326	219 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	KRT72	Q14CN4	511 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	MAPRE2	Q15555	327 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	GSG1	Q2KHT4	349 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	REEP3	Q6NUK4	255 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ULK3	Q6PHR2	472 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	CARM1	Q86X55	608 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	SNX32	Q86XE0	403 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	RNF217	Q8TC41	542 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	HPS1	Q92902	700 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	HAX1	O00165	279 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	SERPINI2	O75830	405 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	KRT34	O76011	436 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	IFNGR1	P15260	489 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ITGA2	P17301	1181 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	PRDX6	P30041	224 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	ALDH3B1	P43353	468 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	GIPR	P48546	466 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	CDH12	P55289	794 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	NCALD	P61601	193 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	PUDP	Q08623	228 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	CAMK2D	Q13557	499 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CTIF-208	ENST00000590422	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms