RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 PNPP00491 289 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 ATP1B1P05026 303 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 CD99P14209 185 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 S1PR1P21453 382 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 MPZP25189 248 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 LMO1P25800 156 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 CASP3P42574 277 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 DIO3P55073 304 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 STX1BP61266 288 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 BIKQ13323 160 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 OR1C1Q15619 314 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 IL23RQ5VWK5 629 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 SPINK14Q6IE38 97 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 Q75L30 129 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 EID3Q8N140 333 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
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ATG4D-210ENST00000588972 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 TXNDC15Q96J42 360 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 GPR137Q96N19 417 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
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ATG4D-210ENST00000588972 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.81□□□□□ -1.32
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ATG4D-210ENST00000588972 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 PSME2Q9UL46 239 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 hDV102S1A0JD36 115 aa6.8□□□□□ -1.32
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ATG4D-210ENST00000588972 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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ATG4D-210ENST00000588972 TNFRSF1BP20333 461 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 GPX3P22352 226 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 NTSP30990 170 aa6.8□□□□□ -1.32
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ATG4D-210ENST00000588972 SSR4P51571 173 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
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ATG4D-210ENST00000588972 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM64Q6YI46 380 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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ATG4D-210ENST00000588972 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM156Q8N614 296 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 MDS2Q8NDY4 140 aa6.8□□□□□ -1.32
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ATG4D-210ENST00000588972 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.8□□□□□ -1.32
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ATG4D-210ENST00000588972 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.8□□□□□ -1.32
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ATG4D-210ENST00000588972 STAB1Q9NY15 2570 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 GTF3C1Q12789 2109 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.79□□□□□ -1.32
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ATG4D-210ENST00000588972 G3V3Y1 287 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF195O14628 629 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 HDAC3O15379 428 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 SPRY3O43610 288 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 SELENOFO60613 162 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 WISP2O76076 250 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 LAMP1P11279 417 aa6.79□□□□□ -1.32
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