RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576221.1

PCTP-208, Transcript of phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

TSL 5

Gene PCTP, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTP-208ENST00000576221 ERVK-25P63136 954 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 TGFBR3Q03167 851 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 FAM27E3Q08E93 113 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 COX10Q12887 443 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ITGADQ13349 1161 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 CAMK2DQ13557 499 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 P2RY6Q15077 328 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ACKR1Q16570 336 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 RFX4Q33E94 735 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 TSPO2Q5TGU0 170 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 C9orf135Q5VTT2 229 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ALKBH2Q6NS38 261 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 Q6ZT83 130 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 SVOPLQ8N434 492 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 OR6X1Q8NH79 312 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 TEX47Q8TBZ9 253 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ZNF566Q969W8 418 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 NRBF2Q96F24 287 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 RBP7Q96R05 134 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 FEVQ99581 238 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 PKP2Q99959 881 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 KATNB1Q9BVA0 655 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 IFT27Q9BW83 186 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 TEX12Q9BXU0 123 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ULBP2Q9BZM5 246 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 OR52D1Q9H346 318 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 SLC24A3Q9HC58 644 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 S100A14Q9HCY8 104 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 SLC7A10Q9NS82 523 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 GALNT8Q9NY28 637 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 JKAMPQ9P055 326 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 IL20RAQ9UHF4 553 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 GPR52Q9Y2T5 361 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ARHGEF9O43307 516 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 KLF4O43474 513 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 PTP4A3O75365 173 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 UPK3AO75631 287 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 LYZL6O75951 148 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 PPP1R3DO95685 299 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 FREM3P0C091 2139 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 COX6B1P14854 86 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ACADSP16219 412 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 POU1F1P28069 291 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 MPGP29372 298 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 NTF4P34130 210 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 RIPPLY3P57055 190 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 CD47Q08722 323 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 STK11Q15831 433 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 FNDC8Q8TC99 324 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 LRR1Q96L50 414 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 SAMD8Q96LT4 415 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ZNF570Q96NI8 536 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 OR2M2Q96R28 347 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 GPA33Q99795 319 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 MED18Q9BUE0 208 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 NTN4Q9HB63 628 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 GLTPQ9NZD2 209 aa6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PCTP-208ENST00000576221 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms