RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	PDE7B	Q9NP56	450 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	FITM1	A5D6W6	292 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	FRG2C	A6NGY1	282 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	OIP5	O43482	229 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	F13B	P05160	661 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	GLUL	P15104	373 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		16.73	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF254	O75437	659 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	IFNA7	P01567	189 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	HPX	P02790	462 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	P2RX1	P51575	399 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN12	P56749	244 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	APOOL	Q6UXV4	268 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	GPR148	Q8TDV2	347 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM19	Q9H013	955 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	KLK11	Q9UBX7	282 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	EML5	Q05BV3	1969 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PQ72	361 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00862	A6NCI5	91 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TLCD2	A6NGC4	264 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ALOX5AP	P20292	161 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	C4BPB	P20851	252 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CDK2	P24941	298 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MST1	P26927	711 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TACR3	P29371	465 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEB1	P43366	347 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LTB	Q06643	244 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MEST	Q5EB52	335 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	GKN2	Q86XP6	184 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	NOX3	Q9HBY0	568 aa		16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	16.72	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	C4orf47	A7E2U8	309 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SYP	P08247	313 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CPN1	P15169	458 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SOX2	P48431	317 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	VEGFC	P49767	419 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LBX1	P52954	281 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	DCAF7	P61962	342 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MARVELD3	Q96A59	401 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	INTS14	Q96SY0	518 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	OR10A4	Q9H209	315 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	BEX1	Q9HBH7	125 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	LANCL2	Q9NS86	450 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CEP290	O15078	2479 aa		16.71	■□□□□ 0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	LEUTX	A8MZ59	168 aa		16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	DCTN6	O00399	190 aa		16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	ADRA2C	P18825	462 aa		16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF81	P51508	661 aa		16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	TAS2R20	P59543	309 aa		16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	ZP1	P60852	638 aa		16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	SNTA1	Q13424	505 aa		16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	OR8H3	Q8N146	312 aa		16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	SPIC	Q8N5J4	248 aa		16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	TAAR8	Q969N4	342 aa		16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	OR1F2P	Q96R84	312 aa		16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	16.7	■□□□□ 0.26
RRN3-205	ENST00000563559	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		16.7	■□□□□ 0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms