RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539305.1

AP002991.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AP002991.1, Length 574 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002991.1-201ENST00000539305 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 ARR3P36575 388 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 CAPZA2P47755 286 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 ATP4BP51164 291 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 RUNX1T1Q06455 604 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 PMS2P3Q13401 168 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 MFSD13AQ14CX5 517 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 UEVLDQ8IX04 471 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 HIPK4Q8NE63 616 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 OR4F15Q8NGB8 312 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 OR6S1Q8NH40 331 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 TAMM41Q96BW9 452 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 MCHR1Q99705 422 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 TPK1Q9H3S4 243 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 TMEM160Q9NX00 188 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.25□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 EVPLLA8MZ36 301 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 C11orf98E9PRG8 122 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 SERPINB7O75635 380 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 PDE5AO76074 875 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 TGFAP01135 160 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 ADORA3P0DMS8 318 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 TNFRSF1BP20333 461 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 AHCYP23526 432 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 GIFP27352 417 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 GIPRP48546 466 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 GZMKP49863 264 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 PPOXP50336 477 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 BIDP55957 195 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 RAB1AP62820 205 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 PUDPQ08623 228 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 RIN1Q13671 783 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 DAG1Q14118 895 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 SQLEQ14534 574 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 MELKQ14680 651 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 RAB39AQ14964 217 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 ZNF74Q16587 644 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 FXNQ16595 210 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 ZNF627Q7L945 461 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 PXKQ7Z7A4 578 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 DHDDSQ86SQ9 333 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 KRT73Q86Y46 540 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 DPP10Q8N608 796 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 CKAP2Q8WWK9 683 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 TMEM54Q969K7 222 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 C1orf159Q96HA4 380 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 LRR1Q96L50 414 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 CGREF1Q99674 301 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 SH3GL3Q99963 347 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 SYT3Q9BQG1 590 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 TMEM43Q9BTV4 400 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.24□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.23□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 NDUFS8O00217 210 aa7.23□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 CLPTM1O96005 669 aa7.23□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 IFNA2P01563 188 aa7.23□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 HPXP02790 462 aa7.23□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 CSF3P09919 207 aa7.23□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 CCL2P13500 99 aa7.23□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 FUT1P19526 365 aa7.23□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 PPIBP23284 216 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
AP002991.1-201ENST00000539305 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms