RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	ITGAD	Q13349	1161 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	P2RY6	Q15077	328 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	RCN1	Q15293	331 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ADCK1	Q86TW2	530 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	PARP8	Q8N3A8	854 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF566	Q969W8	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	KRT84	Q9NSB2	600 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	VNN3	Q9NY84	501 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730		H3BN98	237 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	CDC42EP2	O14613	210 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ARPC3	O15145	178 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	MGRN1	O60291	552 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	IFNG	P01579	166 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	HMGN1	P05114	100 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	POU2F1	P14859	743 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ANPEP	P15144	967 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	IFNGR1	P15260	489 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SDHA	P31040	664 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	IST1	P53990	364 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	STK11	Q15831	433 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	NIPAL3	Q6P499	406 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	RPRML	Q8N4K4	120 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	OR2T33	Q8NG76	320 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	STARD4	Q96DR4	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	RDH12	Q96NR8	316 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	RBP7	Q96R05	134 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ALG12	Q9BV10	488 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	OR52D1	Q9H346	318 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	HPR	P00739	348 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	F13B	P05160	661 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	PRF1	P14222	555 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	IGFBP5	P24593	272 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ALDH3A2	P51648	485 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	BID	P55957	195 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	CLRN1	P58418	232 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	RIPK1	Q13546	671 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ACKR1	Q16570	336 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730		Q6ZT83	130 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	KDM8	Q8N371	416 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	NAXE	Q8NCW5	288 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF570	Q96NI8	536 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SNX18	Q96RF0	628 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	IFT27	Q9BW83	186 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	OR10A4	Q9H209	315 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	C12orf49	Q9H741	205 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ASB6	Q9NWX5	421 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	USE1	Q9NZ43	259 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SLC35F4	A4IF30	521 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730		A8MXE2	369 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ZG16	O60844	167 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	RAMP1	O60894	148 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SERPINI2	O75830	405 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	ACADS	P16219	412 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	FUT4	P22083	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	CSNK1A1	P48729	337 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	FOXF2	Q12947	444 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	DAG1	Q14118	895 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-224	ENST00000534730	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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