RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520721.1

IGHV3-22-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHV3-22, Length 359 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZP4Q12836 540 aa14.96□□□□□ -0.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 CARD17Q5XLA6 110 aa14.96□□□□□ -0.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 MDP1Q86V88 176 aa14.96□□□□□ -0.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.96□□□□□ -0.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.96□□□□□ -0.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.96□□□□□ -0.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 MPP4Q96JB8 637 aa14.96□□□□□ -0.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZNF583Q96ND8 569 aa14.96□□□□□ -0.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.96□□□□□ -0.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.96□□□□□ -0.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 SLC19A3Q9BZV2 496 aa14.96□□□□□ -0.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 PLK3Q9H4B4 646 aa14.96□□□□□ -0.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.96□□□□□ -0.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 USP22Q9UPT9 525 aa14.96□□□□□ -0.01
IGHV3-22-201ENST00000520721 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 B9A039 149 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 OR4A8P0C604 315 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ADORA3P0DMS8 318 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 SLC25A16P16260 332 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ARFIP2P53365 341 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 CAMK2DQ13557 499 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 REP15Q6BDI9 236 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 FAM168AQ92567 244 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 SH3GL1Q99961 368 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 NOX3Q9HBY0 568 aa14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 VWC2LB2RUY7 222 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 C11orf98E9PRG8 122 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 CH25HO95992 272 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 IFNGR1P15260 489 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 AHCYP23526 432 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 OR6X1Q8NH79 312 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 PROX1Q92786 737 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TMEM54Q969K7 222 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ECSITQ9BQ95 431 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 NANSQ9NR45 359 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.94□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TMEM129A0AVI4 362 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZNF726A6NNF4 738 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 MRASO14807 208 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 HLA-HP01893 362 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 CSF3P09919 207 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 THBS4P35443 961 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 BIDP55957 195 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 VLDLRP98155 873 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 CARM1Q86X55 608 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 SNX32Q86XE0 403 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 IL17RDQ8NFM7 739 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 OR6N1Q8NGY5 312 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 C10orf82Q8WW14 230 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 DOK1Q99704 481 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ULBP2Q9BZM5 246 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.93□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 SERPINI2O75830 405 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ZNF35P13682 527 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 TNFRSF1BP20333 461 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 PPOXP50336 477 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 NPRL3Q12980 569 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 MAPRE2Q15555 327 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 GSG1Q2KHT4 349 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 MMEL1Q495T6 779 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 LRFN4Q6PJG9 635 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 VHLLQ6RSH7 139 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 MDFIQ99750 246 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 FOXB1Q99853 325 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 BAG5Q9UL15 447 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 POFUT2Q9Y2G5 429 aa14.92□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.91□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 KRT34O76011 436 aa14.91□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 OR6A2O95222 327 aa14.91□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 IGF2P01344 180 aa14.91□□□□□ -0.02
IGHV3-22-201ENST00000520721 MT-ND1P03886 318 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms