RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514845.5

CAST-241, Transcript of calpastatin, humanhuman

TSL 4

Gene CAST, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAST-241ENST00000514845 MFSD13AQ14CX5 517 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 PDCD1Q15116 288 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 MMEL1Q495T6 779 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 Q6ZSV7 163 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 XAGE5Q8WWM1 108 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 UPRTQ96BW1 309 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 ROPN1LQ96C74 230 aa7.07□□□□□ -1.28
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CAST-241ENST00000514845 ITPKCQ96DU7 683 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 MTERF3Q96E29 417 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 NEURL3Q96EH8 262 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 EMC6Q9BV81 110 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.07□□□□□ -1.28
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CAST-241ENST00000514845 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7.06□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.06□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 A8MVM7 634 aa7.06□□□□□ -1.28
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CAST-241ENST00000514845 G3V2L1 256 aa7.06□□□□□ -1.28
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CAST-241ENST00000514845 NPIPB7O75200 414 aa7.06□□□□□ -1.28
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CAST-241ENST00000514845 ANKFN1Q8N957 763 aa7.06□□□□□ -1.28
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CAST-241ENST00000514845 IGHV4-59P01825 116 aa7.05□□□□□ -1.28
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CAST-241ENST00000514845 TFPTP0C1Z6 253 aa7.05□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 PRG2P13727 222 aa7.05□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 CBLP22681 906 aa7.05□□□□□ -1.28
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CAST-241ENST00000514845 MMP15P51511 669 aa7.05□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 SELENOVP59797 346 aa7.05□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 EGR3Q06889 387 aa7.05□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 ZMYND11Q15326 602 aa7.05□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 GPAT3Q53EU6 434 aa7.05□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.05□□□□□ -1.28
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CAST-241ENST00000514845 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa7.05□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 DDIASQ8IXT1 998 aa7.05□□□□□ -1.28
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CAST-241ENST00000514845 ZNF519Q8TB69 540 aa7.05□□□□□ -1.28
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CAST-241ENST00000514845 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 MOAP1Q96BY2 351 aa7.05□□□□□ -1.28
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CAST-241ENST00000514845 TXNDC15Q96J42 360 aa7.05□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 OXGR1Q96P68 337 aa7.05□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 EXD2Q9NVH0 621 aa7.05□□□□□ -1.28
CAST-241ENST00000514845 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.05□□□□□ -1.28
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