RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 SSR4P51571 173 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC16A14Q7RTX9 510 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM135Q86UB9 458 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 PDIK1LQ8N165 341 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 GABRG1Q8N1C3 465 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 EID2Q8N6I1 236 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXL13Q8NEE6 735 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 BPIFCQ8NFQ6 507 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4A4PQ8NGN8 299 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 RHEBL1Q8TAI7 183 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 FANK1Q8TC84 345 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ARPC1AQ92747 370 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 FCRL1Q96LA6 429 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 HES7Q9BYE0 225 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 DEFB127Q9H1M4 99 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 OR51M1Q9H341 326 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 SRMSQ9H3Y6 488 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 CLCF1Q9UBD9 225 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 THSD7BQ9C0I4 1608 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ERVV-1B6SEH8 477 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 SIRPB1O00241 398 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 CDC7O00311 574 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 EEDO75530 441 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 FGGP02679 453 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 STAG3L3P0CL85 134 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ICAM2P13598 275 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 KLK2P20151 261 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB25P24278 435 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 STOMP27105 288 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 RFX3P48380 749 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 TIMM10P62072 90 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 LCE1EQ5T753 118 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 CTRB2Q6GPI1 263 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 C22orf42Q6IC83 251 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 REEP3Q6NUK4 255 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF544Q6NX49 715 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM53Q6P2H8 277 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF165Q6ZSG1 346 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 OTUD6AQ7L8S5 288 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 KATNAL2Q8IYT4 538 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 IQCKQ8N0W5 287 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 KIR2DL5AQ8N109 375 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 LIX1Q8N485 282 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 PNKDQ8N490 385 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 DCUN1D4Q92564 292 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM101Q96IK0 257 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC29A1Q99808 456 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 RARRES2Q99969 163 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 XCL2Q9UBD3 114 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 GNPTGQ9UJJ9 305 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC25A15Q9Y619 301 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A0G2JLM5 398 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 A8MUA0 341 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 H0YC42 278 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 NDUFAB1O14561 156 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.882e-7■□□□□ 8
RABGGTB-207ENST00000470201 SUPT7LO94864 414 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 LY6G6DO95868 133 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 CHTF8P0CG12 524 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 RALBP11234 206 aa3.29□□□□□ -1.88
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RABGGTB-207ENST00000470201 PRPS1P60891 318 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
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RABGGTB-207ENST00000470201 PEX26Q7Z412 305 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXL16Q8N461 479 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 CXorf40AQ8TE69 158 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-207ENST00000470201 PEX13Q92968 403 aa3.29□□□□□ -1.88
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