RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428963.6

CENPN-204, Transcript of centromere protein N, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CENPN, Length 971 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPN-204ENST00000428963 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.31□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.31□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 OPN4Q9UHM6 478 aa6.31□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.31□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CMAHPQ9Y471 501 aa6.31□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 A0A0G2JK05 382 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 HMGN4O00479 90 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 FAAHO00519 579 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 FRS3O43559 492 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CDC14BO60729 498 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 NPIPB7O75200 414 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 MPZL1O95297 269 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CLPTM1O96005 669 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CHEK2O96017 543 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 FSHBP01225 129 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 HLA-HP01893 362 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 GSNP06396 782 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 DBHP09172 617 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 ZNF35P13682 527 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 PRG2P13727 222 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 AQP5P55064 265 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CLDN8P56748 225 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 MYBPC1Q00872 1141 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 PIGFQ07326 219 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 FXNQ16595 210 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 NATD1Q8N6N6 113 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 POLE3Q9NRF9 147 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CFAP73A6NFT4 308 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 AGAP5A6NIR3 686 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 SMIM23A6NLE4 172 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 VSTM5A8MXK1 200 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 M0R233 179 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 NPHS1O60500 1241 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 PRSS23O95084 383 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 NUDT17P0C025 328 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 PATE4P0C8F1 98 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 PNMTP11086 282 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CD79AP11912 226 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 PRPS1L1P21108 318 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 UQCRC2P22695 453 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CXCR1P25024 350 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 GLRXP35754 106 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 ARR3P36575 388 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CAPZA2P47755 286 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CCT5P48643 541 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 EVX1P49640 407 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 TMEM33P57088 247 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 EGR4Q05215 589 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 FOXL1Q12952 345 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CHI3L2Q15782 390 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 RNF130Q86XS8 419 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 VRK2Q86Y07 508 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 CADM2Q8N3J6 435 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 NEURL3Q96EH8 262 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CENPN-204ENST00000428963 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms