RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SEC14L2O76054 403 aa18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 IGFBP5P24593 272 aa18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 CAPZA2P47755 286 aa18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 EVX1P49640 407 aa18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 DAG1Q14118 895 aa18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 SLC30A8Q8IWU4 369 aa18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 OR5J2Q8NH18 312 aa18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 TSPEARQ8WU66 669 aa18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 MCHR1Q99705 422 aa18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 EMC6Q9BV81 110 aa18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFAF1Q9Y375 327 aa18.14■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF726A6NNF4 738 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 STAMBPO95630 424 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 NR4A1P22736 598 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP7Q16829 419 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 CARD17Q5XLA6 110 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF813Q6ZN06 617 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA21Q7Z572 469 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 SVOPLQ8N434 492 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 SMYD1Q8NB12 490 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 TXNDC15Q96J42 360 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 CGREF1Q99674 301 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 FOXB1Q99853 325 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ULBP2Q9BZM5 246 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL3Q9UKT7 428 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 POFUT2Q9Y2G5 429 aa18.13■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 LRRN3E7EW58 273 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 M0R3H8 397 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-HP01893 362 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 TACSTD2P09758 323 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 DAOP14920 347 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 NPTX1Q15818 432 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 CARTPTQ16568 116 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 CYP51A1Q16850 503 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 IQCCQ4KMZ1 466 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 WDFY1Q8IWB7 410 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF786Q8N393 782 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 GPR32P1Q8NGA4 272 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 OR6T1Q8NGN1 323 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 OR6N1Q8NGY5 312 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 CKAP2Q8WWK9 683 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 SLC19A3Q9BZV2 496 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHAC1Q9H158 963 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF224Q9NZL3 707 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM33Q9UPN9 1127 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 CMAHPQ9Y471 501 aa18.12■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ANGPT2O15123 496 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 UBL3O95164 117 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF35P13682 527 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 SRD5A1P18405 259 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 AHCYP23526 432 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ZP4Q12836 540 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 CAMK2DQ13557 499 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF74Q16587 644 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ENTPD8Q5MY95 495 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 KRT80Q6KB66 452 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 RETREG3Q86VR2 466 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 CDK20Q8IZL9 346 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf53Q8N6V4 93 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 OR6X1Q8NH79 312 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 HPS1Q92902 700 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEB18Q96M61 343 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 SIKE1Q9BRV8 207 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF426Q9BUY5 554 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 DYNLRB1Q9NP97 96 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 SPEF1Q9Y4P9 236 aa18.11■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 M0QX08 132 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 LYPD3O95274 346 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ADORA3P0DMS8 318 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 CD79AP11912 226 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 B4GALT1P15291 398 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 HNF1AP20823 631 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 GLRXP35754 106 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 CSNK1A1P48729 337 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 CHN2P52757 468 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 MTPNP58546 118 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 SELPLGQ14242 412 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 FAM120AOSQ5T036 256 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 WDR88Q6ZMY6 472 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM54Q969K7 222 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 MS4A3Q96HJ5 214 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 MPP4Q96JB8 637 aa18.1■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 SYNGR3O43761 229 aa18.09■□□□□ 0.49
LIMS1-208ENST00000428064 ENTPD5O75356 428 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms