RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR76Q9H967 626 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FANCFQ9NPI8 374 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SDHAF2Q9NX18 166 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 H0YGG7 62 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RCBTB2O95199 551 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 AK4P27144 223 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PRMT2P55345 433 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HTR4Q13639 388 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CST6Q15828 149 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF74Q16587 644 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GXYLT1Q4G148 440 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM240Q5SV17 173 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TANGO2Q6ICL3 276 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2AK2Q8NG84 335 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8H1Q8NGG4 311 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RBCK1Q9BYM8 510 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DPAGT1Q9H3H5 408 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 EFCAB7A8K855 629 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF879B4DU55 563 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FLRT2O43155 660 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL6IP5O75915 188 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 AQP8O94778 261 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TOXO94900 526 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFB2O95178 105 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LRG1P02750 347 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PCCBP05166 539 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TOMM20Q15388 145 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 STK11Q15831 433 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MAMSTRQ6ZN01 415 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5M8Q8NGP6 311 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 BAIAP2Q9UQB8 552 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVK-19Q9WJR5 959 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 F8VVB4 439 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 F8VWA3 439 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 XRCC3O43542 346 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 BLVRAP53004 296 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R41P59536 307 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 UNC119Q13432 240 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF345Q14585 488 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFAF6Q330K2 333 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FCRLAQ7L513 359 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52B4Q8NGK2 314 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1J4Q8NGS1 313 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4K13Q8NH42 304 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PATE1Q8WXA2 126 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8D1Q8WZ84 308 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PTCHD1Q96NR3 888 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SFXN1Q9H9B4 322 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 EQTNQ9NQ60 294 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC2A8Q9NY64 477 aa3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 CALCBP10092 127 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DAB2P98082 770 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10H4Q8NGA5 316 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF519Q8TB69 540 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GPBAR1Q8TDU6 330 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS15Q8TE58 950 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TBX5Q99593 518 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 BEX1Q9HBH7 125 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFSF18Q9UNG2 199 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 I3L521 148 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTL6AO96019 429 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DHFRP00374 187 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ACRP10323 421 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB25P24278 435 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 UCP2P55851 309 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR18Q14330 331 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR2DS3Q14952 304 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM69AQ5T7M9 428 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 OTULINQ96BN8 352 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ELMOD3Q96FG2 381 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP3Q96NJ6 502 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 DPYSL5Q9BPU6 564 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC17A9Q9BYT1 436 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAP2Q9NPF8 381 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 UNC13CQ8NB66 2214 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFRSF10CO14798 259 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 AK1P00568 194 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 RPN2P04844 631 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV4-34P06331 123 aa3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms