RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 SLC51BQ86UW2 128 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf123Q9NWV4 160 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM72A0PK05 275 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 HEPACAM2A8MVW5 462 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LILRB3O75022 631 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TXNDC12O95881 172 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC2A1P11166 492 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 GPX2P18283 190 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 MAKP20794 623 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 DPP4P27487 766 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SFTPDP35247 375 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 BMPR1AP36894 532 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SIRPAP78324 504 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ACSM1Q08AH1 577 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 MPPED2Q15777 294 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 DUSP6Q16828 381 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PAQR6Q6TCH4 344 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 UBTD2Q8WUN7 234 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 IL23AQ9NPF7 189 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0J9YY10 115 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ZFAND5O76080 213 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 F13BP05160 661 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CLEC3BP05452 202 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CD46P15529 392 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 MTNR1BP49286 362 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 FABP6P51161 128 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TLE1Q04724 770 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TNK1Q13470 666 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CRMP1Q14194 572 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 AFMIDQ63HM1 303 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RFLNAQ6ZTI6 216 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM106AQ96A25 262 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ULBP2Q9BZM5 246 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 GNG12Q9UBI6 72 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 MICAL3Q7RTP6 2002 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 HLA-FP30511 346 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NTHL1P78549 312 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PLA2G7Q13093 441 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 EBPQ15125 230 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 YIF1BQ5BJH7 314 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ADAM5Q6NVV9 412 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 UQCC2Q9BRT2 126 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 OR52A5Q9H2C5 316 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 EHFQ9NZC4 300 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 DNAJC13O75165 2243 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 DDAH2O95865 285 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 MT-ND4LP03901 98 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RAC1P63000 192 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF684Q5T5D7 378 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CD276Q5ZPR3 534 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 FBXW12Q6X9E4 464 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 DMBX1Q8NFW5 382 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 KATNB1Q9BVA0 655 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NOX4Q9NPH5 578 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 C17orf105B2RV13 164 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 DFFBO76075 338 aa8.2□□□□□ -1.1
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