RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 S1PR5Q9H228 398 aa7.22□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 A0A0D9SG52 128 aa7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 A0A1W2PS29 197 aa7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 AGAP14A8MT82 685 aa7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 IMPA2O14732 288 aa7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 LY86O95711 162 aa7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 OPRD1P41143 372 aa7.21□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 Q6ZNB5 142 aa7.21□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 SLC35F3Q8IY50 421 aa7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 C14orf79Q96F83 325 aa7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.21□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ZFP57Q9NU63 452 aa7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.21□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.21□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 PNLIPP16233 465 aa7.21□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 CD1CP29017 333 aa7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ART1P52961 327 aa7.21□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.21□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 FBXL4Q9UKA2 621 aa7.21□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 IGLV3-27P01718 113 aa7.21□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 AMY2AP04746 511 aa7.21□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 PROX2Q3B8N5 592 aa7.21□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.21□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.21□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 COX15Q7KZN9 410 aa7.21□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZNF546Q86UE3 836 aa7.21□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 GPR26Q8NDV2 337 aa7.21□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.21□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.263e-7■■■□□ 15.1
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USP3-201ENST00000268049 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.21□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 SIPA1L1O43166 1804 aa7.21□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 SCO1O75880 301 aa7.21□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 BMP5P22003 454 aa7.21□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 RAB3CQ96E17 227 aa7.21□□□□□ -1.26
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USP3-201ENST00000268049 ANKRD10Q9NXR5 420 aa7.21□□□□□ -1.26
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