RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609706.1

ANKRD54-212, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

Gene ANKRD54, Length 1,140 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-212ENST00000609706 M0R3G1 203 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 CHP2O43745 196 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 PDE5AO76074 875 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 LY6HO94772 140 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 CSF3P09919 207 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 BMP4P12644 408 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 SLC25A16P16260 332 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 CD247P20963 164 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 EFNA4P52798 201 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 ADIPOQQ15848 244 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 MS4A18Q3C1V0 323 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 CARD17Q5XLA6 110 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 WDR88Q6ZMY6 472 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 WDFY1Q8IWB7 410 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 C20orf196Q8IYI0 205 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 OR4D11Q8NGI4 311 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 FAM168AQ92567 244 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 TAMM41Q96BW9 452 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 SORCS2Q96PQ0 1159 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 EMC6Q9BV81 110 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa13.79□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 M0QX08 132 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 FXYD1O00168 92 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 GPRIN2O60269 458 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 LYPD3O95274 346 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 THY1P04216 161 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 C8BP07358 591 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 CBR1P16152 277 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 CRYBA2P53672 197 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 PMS2P3Q13401 168 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 TMEM249Q2WGJ8 235 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 ENTPD8Q5MY95 495 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 VHLLQ6RSH7 139 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 NHLRC1Q6VVB1 395 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 MDP1Q86V88 176 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 SLC30A8Q8IWU4 369 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 C10orf53Q8N6V4 93 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 NUP37Q8NFH4 326 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 OR10A6Q8NH74 314 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 C10orf105Q8TEF2 133 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 YAE1D1Q9NRH1 226 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 NOX1Q9Y5S8 564 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 FKBP7Q9Y680 259 aa13.78□□□□□ -0.2
ANKRD54-212ENST00000609706 FBP2O00757 339 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 PLPP3O14495 311 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 SERPINI2O75830 405 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 MT-ATP6P00846 226 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 OR4A8P0C604 315 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 SERPINF1P36955 418 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 GZMMP51124 257 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 HGFACQ04756 655 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 NPRL3Q12980 569 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 EFNB3Q15768 340 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 ZNF74Q16587 644 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 VMACQ2NL98 169 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 C6orf52Q5T4I8 152 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 METTL21CQ5VZV1 264 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 LINC00114Q6XXX2 140 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 OR5J2Q8NH18 312 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 TXNDC15Q96J42 360 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 ULBP2Q9BZM5 246 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 NOX3Q9HBY0 568 aa13.77□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 SLC35F4A4IF30 521 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 F12P00748 615 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 AHCYP23526 432 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 ARR3P36575 388 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 CAPZA2P47755 286 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 VLDLRP98155 873 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 RABL3Q5HYI8 236 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 PXKQ7Z7A4 578 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 ANKS4BQ8N8V4 417 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 OR4F15Q8NGB8 312 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 LRR1Q96L50 414 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 ZNF426Q9BUY5 554 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 PCDHAC1Q9H158 963 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 PLK3Q9H4B4 646 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 ZNF442Q9H7R0 627 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 SLC7A7Q9UM01 511 aa13.76□□□□□ -0.21
ANKRD54-212ENST00000609706 USP22Q9UPT9 525 aa13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms