RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 RAF1P04049 648 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 SEMG1P04279 462 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 ALPLP05186 524 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 LAMP1P11279 417 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 ERGP11308 486 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 HLA-DOBP13765 273 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 ETS2P15036 469 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 NELFEP18615 380 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 IDSP22304 550 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 GDI1P31150 447 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 SRD5A2P31213 254 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 KDELR2P33947 212 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 SFTPDP35247 375 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 AHRP35869 848 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 DCTP40126 519 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFRSF4P43489 277 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 ALDH3B2P48448 385 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 CCR8P51685 355 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 GABARAPL2P60520 117 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 SSTP61278 116 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS21P63220 83 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 RPP38P78345 283 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 REEP5Q00765 189 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 RELQ04864 619 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 RBBP4Q09028 425 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 C2orf80Q0P641 193 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 FADDQ13158 208 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 IL18R1Q13478 541 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 ENPP2Q13822 863 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 IRF4Q15306 451 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 CYBRD1Q53TN4 286 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF542PQ5EBM4 170 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 C9orf50Q5SZB4 431 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 ADNP2Q6IQ32 1131 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM40Q6P9F5 258 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 PAGE2Q7Z2X7 111 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 CACUL1Q86Y37 369 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF547Q8IVP9 402 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC30A8Q8IWU4 369 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 CDK20Q8IZL9 346 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 OFCC1Q8IZS5 231 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 CLECL1Q8IZS7 167 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 METTL4Q8N3J2 472 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS35Q8N3Z0 413 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM86B1Q8N7N1 296 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF114Q8NC26 417 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5AR1Q8NGP9 310 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5K2Q8NHB8 316 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 GRHL3Q8TE85 626 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 GANCQ8TET4 914 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFP90Q8TF47 636 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 C16orf78Q8WTQ4 265 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 SMPDL3AQ92484 453 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 FCGR1BQ92637 280 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 PPCDCQ96CD2 204 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 NRBF2Q96F24 287 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGED4Q96JG8 741 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 IL17FQ96PD4 163 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 AIF1LQ9BQI0 150 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 PIGQQ9BRB3 760 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35A5Q9BS91 424 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 TIMM29Q9BSF4 260 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB33BQ9H082 229 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 CSTL1Q9H114 145 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 NT5DC2Q9H857 520 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 REEP1Q9H902 201 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 TPT1P8Q9HAU6 139 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 NTN4Q9HB63 628 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 TM9SF3Q9HD45 589 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 FANCFQ9NPI8 374 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 CD93Q9NPY3 652 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 COPS7AQ9UBW8 275 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 TAC3Q9UHF0 121 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 MGAT4BQ9UQ53 548 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 ANGPT4Q9Y264 503 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 NSG2Q9Y328 171 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 GMEB1Q9Y692 573 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 VCANP13611 3396 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 BRCA2P51587 3418 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 MYO7AQ13402 2215 aa3.71□□□□□ -1.82
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