RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589055.3

TMEM259-206, Transcript of transmembrane protein 259, human

TSL 3

Gene TMEM259, Length 791 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-206	ENST00000589055	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	GPRIN2	O60269	458 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	PPP2R2B	Q00005	443 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	NAAA	Q02083	359 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	MST1L	Q2TV78	715 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	REP15	Q6BDI9	236 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	ASPN	Q9BXN1	380 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	NOX3	Q9HBY0	568 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	SLC35F4	A4IF30	521 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	C11orf98	E9PRG8	122 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055		H7C417	338 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	PLPP3	O14495	311 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	CHP2	O43745	196 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	FMO6P	O60774	539 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	IGLV1-44	P01699	117 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	AHCY	P23526	432 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	ARFIP2	P53365	341 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	PUDP	Q08623	228 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	NPRL3	Q12980	569 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	KLF10	Q13118	480 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	CAMK2D	Q13557	499 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	RAB35	Q15286	201 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	VMAC	Q2NL98	169 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF613	Q6PF04	617 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	SNX32	Q86XE0	403 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	SCAI	Q8N9R8	606 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	OR6S1	Q8NH40	331 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	ATR	Q13535	2644 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	MRAS	O14807	208 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	CH25H	O95992	272 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	CAPZA2	P47755	286 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	GUCY1A3	Q02108	690 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	MDP1	Q86V88	176 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	OR5J2	Q8NH18	312 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	SAR1A	Q9NR31	198 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	CA10	Q9NS85	328 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	KRT34	O76011	436 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	IGKV3-15	P01624	115 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	HLA-H	P01893	362 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	CRYAA	P02489	173 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	ADORA3	P0DMS8	318 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	B4GALT1	P15291	398 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	BID	P55957	195 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	HGFAC	Q04756	655 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	MELK	Q14680	651 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF74	Q16587	644 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	CARM1	Q86X55	608 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	LRRC58	Q96CX6	371 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	OR4A8	P0C604	315 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	IFNGR1	P15260	489 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TMEM259-206	ENST00000589055	CBR1	P16152	277 aa		13.85	□□□□□ -0.19

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