RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552817.5

TARBP2-219, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 668 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-219	ENST00000552817	ACKR1	Q16570	336 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	LINC00303	Q3SY05	128 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	TMEM225	Q6GV28	225 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	UEVLD	Q8IX04	471 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	OR4K13	Q8NH42	304 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	OR10D3	Q8NH80	312 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	ADGRG7	Q96K78	797 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	LRR1	Q96L50	414 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	TAAR6	Q96RI8	345 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	SCN3B	Q9NY72	215 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	ITPR2	Q14571	2701 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	MED12	Q93074	2177 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	FAM183A	A6NL82	134 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	XKRY	O14609	159 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	DNPH1	O43598	174 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	XPNPEP2	O43895	674 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	IGHM	P01871	453 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	CCDC159	P0C7I6	412 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	HLA-DOB	P13765	273 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	ZNF708	P17019	499 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	ENPP1	P22413	925 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	ACVR2A	P27037	513 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	ACVR1B	P36896	505 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	CLDN15	P56746	228 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	CXCR4	P61073	352 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	CSNK2B	P67870	215 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	HSF1	Q00613	529 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	ITGAD	Q13349	1161 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	CRMP1	Q14194	572 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	MELK	Q14680	651 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	BCL2A1	Q16548	175 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	C3AR1	Q16581	482 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	OCLN	Q16625	522 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	NADK2	Q4G0N4	442 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	EMC4	Q5J8M3	183 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	LEG1	Q6P5S2	330 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	FAM122B	Q7Z309	247 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	GPAT4	Q86UL3	456 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	CPO	Q8IVL8	374 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	GHDC	Q8N2G8	530 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	WBP1	Q96G27	269 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	OXGR1	Q96P68	337 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	UCN2	Q96RP3	112 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	FN3K	Q9H479	309 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	MED20	Q9H944	212 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	AMBN	Q9NP70	447 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	RASD1	Q9Y272	281 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	SH3D21	A4FU49	640 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	SNTN	A6NMZ2	147 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817		M0R3G1	203 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	ARHGEF9	O43307	516 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	RAMP1	O60894	148 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARBP2-219	ENST00000552817	SYNGR4	O95473	234 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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