RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537120.5

DDB1-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene DDB1, Length 1,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1-208ENST00000537120 MTPNP58546 118 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 NAAAQ02083 359 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 PIGFQ07326 219 aa7.3□□□□□ -1.24
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DDB1-208ENST00000537120 CAMK2DQ13557 499 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 GGTLC2Q14390 218 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 C4orf46Q504U0 113 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 C6orf89Q6UWU4 347 aa7.3□□□□□ -1.24
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DDB1-208ENST00000537120 LINGO2Q7L985 606 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 SLC30A8Q8IWU4 369 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 PROX1Q92786 737 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 TXNDC15Q96J42 360 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 CGREF1Q99674 301 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 SH3GL1Q99961 368 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 ECSITQ9BQ95 431 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 EMC6Q9BV81 110 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 BEX2Q9BXY8 128 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 CA10Q9NS85 328 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 USP22Q9UPT9 525 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 M0R3H8 397 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 RNF13O43567 381 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 SEC14L2O76054 403 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 ZNF432O94892 652 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 CH25HO95992 272 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 OPN1SWP03999 348 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 C8BP07358 591 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 CECR9P0C854 216 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 NPR2P20594 1047 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 CD247P20963 164 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 CSNK1A1P48729 337 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 PUDPQ08623 228 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 DAG1Q14118 895 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 ADRM1Q16186 407 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 DUSP7Q16829 419 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 ZNF613Q6PF04 617 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 SPATA21Q7Z572 469 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 MDP1Q86V88 176 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 C20orf196Q8IYI0 205 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 C10orf111Q8N326 155 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 DPP10Q8N608 796 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 SCAIQ8N9R8 606 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 OR6S1Q8NH40 331 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 OR10A6Q8NH74 314 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 TSPEARQ8WU66 669 aa7.29□□□□□ -1.24
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DDB1-208ENST00000537120 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 OR2M2Q96R28 347 aa7.29□□□□□ -1.24
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DDB1-208ENST00000537120 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 TMEM43Q9BTV4 400 aa7.29□□□□□ -1.24
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DDB1-208ENST00000537120 RNF121Q9H920 327 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 MED29Q9NX70 200 aa7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 ATRQ13535 2644 aa7.28□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.28□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 A0A0B4J2E0 115 aa7.28□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 A0A1B0GX12 115 aa7.28□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 TRAPPC13A5PLN9 417 aa7.28□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 LRRN3E7EW58 273 aa7.28□□□□□ -1.24
DDB1-208ENST00000537120 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.28□□□□□ -1.24
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