RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF75AQ96N20 296 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAPBPLQ9BX59 468 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC22A23A1A5C7 686 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STX11O75558 287 aa8.53□□□□□ -1.04
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV2-70P01814 119 aa8.53□□□□□ -1.04
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SBK3P0C264 359 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THRBP10828 461 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B4GALT1P15291 398 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRKP42685 505 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTR3AP46098 478 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBBP4Q09028 425 aa8.53□□□□□ -1.04
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR157Q5UAW9 335 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C6orf89Q6UWU4 347 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRN1Q6UXK5 716 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZG16BQ96DA0 208 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM237Q96Q45 408 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIF1Q9H611 641 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NANOGQ9H9S0 305 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXJ3Q9UPW0 622 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 JRKLQ9Y4A0 524 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.53□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.52□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.52□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C3orf84H3BNL1 204 aa8.52□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT16P08779 473 aa8.52□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.52□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF250P15622 560 aa8.52□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF43P17038 809 aa8.52□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CXCR1P25024 350 aa8.52□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STX2P32856 288 aa8.52□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL15P61313 204 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGF12P61328 243 aa8.52□□□□□ -1.05
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTMPQ5BVD1 217 aa8.52□□□□□ -1.05
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPH5Q9H2P9 285 aa8.52□□□□□ -1.05
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.52□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.52□□□□□ -1.05
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A8MXK9 166 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPIPB8E9PQR5 432 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRCPO75575 148 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VAMP5O95183 116 aa8.51□□□□□ -1.05
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLL1P15814 213 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SDC1P18827 310 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SOAT1P35610 550 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAX2Q02962 417 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLAURQ03405 335 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1DQ13901 141 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZMYND11Q15326 602 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHI3L2Q15782 390 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM153CQ494X1 144 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIK3C3Q8NEB9 887 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF519Q8TB69 540 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDH20Q9HBT6 801 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.51□□□□□ -1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RASD1Q9Y272 281 aa8.51□□□□□ -1.05
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