RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527118.5

RBBP4-218, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-218	ENST00000527118	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	JMJD1C	Q15652	2540 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	SERPINI2	O75830	405 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	IGLV1-44	P01699	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	BMP4	P12644	408 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	AHCY	P23526	432 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	PCGF2	P35227	344 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	CAPZA2	P47755	286 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	PUDP	Q08623	228 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	ZNF613	Q6PF04	617 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	TAMM41	Q96BW9	452 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	CA10	Q9NS85	328 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118		A0A096LNT2	108 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	SLC35F4	A4IF30	521 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	C11orf98	E9PRG8	122 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	PLPP3	O14495	311 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	CHP2	O43745	196 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	CD5L	O43866	347 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	FMO6P	O60774	539 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	IGKV3-15	P01624	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	THY1	P04216	161 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	C8B	P07358	591 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	CBR1	P16152	277 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	CD247	P20963	164 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	PAX7	P23759	505 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	SERPINF1	P36955	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	GZMM	P51124	257 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	EFNA4	P52798	201 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	DSCR9	P59020	149 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	NPRL3	Q12980	569 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	CAMK2D	Q13557	499 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	MDP1	Q86V88	176 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	FAM168A	Q92567	244 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	CRLF1	O75462	422 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	LYPD3	O95274	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	OR4A8	P0C604	315 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	ADORA3	P0DMS8	318 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	CRYBA2	P53672	197 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	VMAC	Q2NL98	169 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	RABL3	Q5HYI8	236 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	OR5J2	Q8NH18	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	NANOG	Q9H9S0	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	ZNF726	A6NNF4	738 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	CH25H	O95992	272 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	MT-ATP6	P00846	226 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	HLA-H	P01893	362 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	BID	P55957	195 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	HGFAC	Q04756	655 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	ZNF74	Q16587	644 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	MMEL1	Q495T6	779 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	REP15	Q6BDI9	236 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	CGB2	Q6NT52	195 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	PXK	Q7Z7A4	578 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	LRRC58	Q96CX6	371 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	LRR1	Q96L50	414 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-218	ENST00000527118	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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