RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 CHRNB3Q05901 458 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 ADIPOQQ15848 244 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 CYP51A1Q16850 503 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 UEVLDQ8IX04 471 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 C20orf196Q8IYI0 205 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 GPR137CQ8N3F9 429 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 PIK3C3Q8NEB9 887 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 FBXO17Q96EF6 278 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 TXNDC15Q96J42 360 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 MCHR1Q99705 422 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 SVEP1Q4LDE5 3571 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXB3-211ENST00000490677 ANGPT2O15123 496 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 CBR1P16152 277 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF613Q6PF04 617 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 TAMM41Q96BW9 452 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 SORCS2Q96PQ0 1159 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 EPYCQ99645 322 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 EMC6Q9BV81 110 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 MED29Q9NX70 200 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM33Q9UPN9 1127 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 PLPP3O14495 311 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 F12P00748 615 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 CRYAAP02489 173 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 METTL21CQ5VZV1 264 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 LRR1Q96L50 414 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 SIKE1Q9BRV8 207 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 B3GNT2Q9NY97 397 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 SLC13A4Q9UKG4 626 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 A0A0G2JND7 137 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 SLC35F4A4IF30 521 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 CHP2O43745 196 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 SEC14L2O76054 403 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 PDE5AO76074 875 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 NQO1P15559 274 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 PCGF2P35227 344 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 SERPINF1P36955 418 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 PUDPQ08623 228 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 NFYCQ13952 458 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 EFNB3Q15768 340 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM249Q2WGJ8 235 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 ENTPD8Q5MY95 495 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF627Q7L945 461 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 RNF217Q8TC41 542 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 FAM168AQ92567 244 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF75AQ96N20 296 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF426Q9BUY5 554 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 ASPNQ9BXN1 380 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHAC1Q9H158 963 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 NOX3Q9HBY0 568 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 SELENONQ9NZV5 590 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 M0R3G1 203 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 FXYD1O00168 92 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 TP53P04637 393 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 BMP4P12644 408 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 SLC25A16P16260 332 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 PMS2P3Q13401 168 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 PXKQ7Z7A4 578 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 MDP1Q86V88 176 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 NUP37Q8NFH4 326 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 OR10A6Q8NH74 314 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF224Q9NZL3 707 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 NOX1Q9Y5S8 564 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 VWC2LB2RUY7 222 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 VLDLRP98155 873 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 IL1RL1Q01638 556 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 CARD17Q5XLA6 110 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC80Q76M96 950 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 CALHM3Q86XJ0 350 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 HIPK1Q86Z02 1210 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 PLK3Q9H4B4 646 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 YAE1D1Q9NRH1 226 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 MT-ATP6P00846 226 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 OR4A8P0C604 315 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 VMACQ2NL98 169 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 C6orf52Q5T4I8 152 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 NANOGP8Q6NSW7 305 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 CGB2Q6NT52 195 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 SLC30A8Q8IWU4 369 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 OR4F15Q8NGB8 312 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 OR5J2Q8NH18 312 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 PROX1Q92786 737 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 KCNS3Q9BQ31 491 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 PRSS27Q9BQR3 290 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-211ENST00000490677 NANOGQ9H9S0 305 aa24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.7 ms