RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490540.1

ASIC3-208, Transcript of acid sensing ion channel subunit 3, human

TSL 2

Gene ASIC3, Length 520 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC3-208	ENST00000490540	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	CD247	P20963	164 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	NAAA	Q02083	359 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	RBBP4	Q09028	425 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	PMS2P3	Q13401	168 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	MST1L	Q2TV78	715 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	RABL3	Q5HYI8	236 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	CGB2	Q6NT52	195 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	OR10A6	Q8NH74	314 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	TAMM41	Q96BW9	452 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	EPYC	Q99645	322 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	USP22	Q9UPT9	525 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC35F4	A4IF30	521 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	C11orf98	E9PRG8	122 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	LYPD3	O95274	346 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	IGLV1-44	P01699	117 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	CRYAA	P02489	173 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	TNFRSF1B	P20333	461 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	PCGF2	P35227	344 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	CAPZA2	P47755	286 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	GZMM	P51124	257 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	CRYBA2	P53672	197 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	HGFAC	Q04756	655 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	CHRNB3	Q05901	458 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	PUDP	Q08623	228 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	NPRL3	Q12980	569 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	CAMK2D	Q13557	499 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	MDP1	Q86V88	176 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	OR6S1	Q8NH40	331 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	NOX3	Q9HBY0	568 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	CA10	Q9NS85	328 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	HAX1	O00165	279 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	FXYD1	O00168	92 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	PLPP3	O14495	311 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	CHP2	O43745	196 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	FMO6P	O60774	539 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	CH25H	O95992	272 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	HLA-H	P01893	362 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	OR4A8	P0C604	315 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	FAM157C	P0CG43	387 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	CBR1	P16152	277 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	AHCY	P23526	432 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	EFNA4	P52798	201 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	KLF10	Q13118	480 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	VMAC	Q2NL98	169 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	REP15	Q6BDI9	236 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF613	Q6PF04	617 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	SCAI	Q8N9R8	606 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	NANOG	Q9H9S0	305 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ASIC3-208	ENST00000490540	ABCA1	O95477	2261 aa		10.4	□□□□□ -0.75
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75

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