RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 CCL19Q99731 98 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 MED29Q9NX70 200 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAM21Q9UKJ8 722 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 A4GNTQ9UNA3 340 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 MGAT4BQ9UQ53 548 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC168Q8NDH2 2452 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 ALPK2Q86TB3 2170 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 M0R1B8 84 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 OR7A10O76100 309 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 ASAH2BP0C7U1 165 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 PTAFRP25105 342 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 CAMK2DQ13557 499 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAM2Q15035 370 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 DEFB107AQ8IZN7 70 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 DEPDC4Q8N2C3 294 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 FITM2Q8N6M3 262 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 OR6N1Q8NGY5 312 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 LRR1Q96L50 414 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR35Q9HC97 309 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 OBP2BQ9NPH6 170 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 TAS2R5Q9NYW4 299 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 NPAP1Q9NZP6 1156 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 RHCGQ9UBD6 479 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 SNX13Q9Y5W8 968 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 HTR3EA5X5Y0 456 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 J3KTA2 159 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 M0R3G1 203 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCD4O14678 606 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 SMPD2O60906 423 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 IGF2P01344 180 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 HSD17B1P14061 328 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 IFNGR1P15260 489 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 PAX7P23759 505 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 BIDP55957 195 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 CEACAM16Q2WEN9 425 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 TBRG1Q3YBR2 411 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 HIKESHIQ53FT3 197 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAM5Q6NVV9 412 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD16Q6P6B7 361 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 SPNS3Q6ZMD2 512 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC35D2Q76EJ3 337 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 LINGO2Q7L985 606 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 RRM2BQ7LG56 351 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF611Q8N823 705 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 FBXW5Q969U6 566 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 RADILQ96JH8 1075 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 PIP5K1AQ99755 562 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 CXXC4Q9H2H0 198 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 CRLF2Q9HC73 371 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM53CQ9NYF3 392 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 ROS1P08922 2347 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 B2RBV5 119 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 IFI30P13284 250 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 ARF1P84077 181 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 C20orf196Q8IYI0 205 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 CDK20Q8IZL9 346 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 OFCC1Q8IZS5 231 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM123Q8N131 208 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM171Q8WVE6 324 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 BOD1Q96IK1 185 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 GORASP2Q9H8Y8 452 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 C20orf141Q9NUB4 165 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 POU2F3Q9UKI9 436 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 POFUT2Q9Y2G5 429 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 ENPP4Q9Y6X5 453 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 CSMD2Q7Z408 3487 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 CADP27708 2225 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A096LPE4 126 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1W2PPZ6 126 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1W2PRG6 482 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 BCL10O95999 233 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 CD40P25942 277 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 SPATS1Q496A3 300 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC22A25Q6T423 547 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 NHLRC1Q6VVB1 395 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 KBTBD8Q8NFY9 601 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 OR6X1Q8NH79 312 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 BPIFA2Q96DR5 249 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 ULBP2Q9BZM5 246 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP4-209ENST00000484097 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms