RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 KCNJ15Q99712 375 aa11.65□□□□□ -0.54
SOGA3-207ENST00000481848 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
SOGA3-207ENST00000481848 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.65□□□□□ -0.54
SOGA3-207ENST00000481848 CLDN5O00501 218 aa11.65□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF787Q6DD87 383 aa11.65□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 APH1AQ96BI3 265 aa11.65□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SVILO95425 2214 aa11.65□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TNFSF9P41273 254 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 Q6ZRG5 221 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 FAM163BP0C2L3 166 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 MPPED2Q15777 294 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PGGHGQ32M88 737 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 HSPB8Q9UJY1 196 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 POMT2Q9UKY4 750 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF320A2RRD8 509 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM71Q6P5X7 295 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF558Q96NG5 402 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 GPA33Q99795 319 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 LILRB3O75022 631 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 STBD1O95210 358 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 RRASP10301 218 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 F3P13726 295 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 GPR12P47775 334 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 CDONQ4KMG0 1287 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 CREB3L4Q8TEY5 395 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM9BQ9NQ34 198 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 OR1A2Q9Y585 309 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 RTCAO00442 366 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 OR6K2Q8NGY2 324 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SIX2Q9NPC8 291 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 DISP1Q96F81 1524 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 GJA4P35212 333 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 UNC50Q53HI1 259 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SLC22A24Q8N4F4 322 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 POM121Q96HA1 1249 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 LHX6Q9UPM6 363 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 POP7O75817 140 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 FDXRP22570 491 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 CCNOP22674 350 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 GABRA3P34903 492 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 RGNQ15493 299 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 EXT1Q16394 746 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PM20D1Q6GTS8 502 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PLK3Q9H4B4 646 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SLC35A1P78382 337 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TAF10Q12962 218 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF528Q3MIS6 628 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SMOC2Q9H3U7 446 aa11.64□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 MBTPS1Q14703 1052 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 C4orf32Q8N8J7 132 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PPTC7Q8NI37 304 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 AKR1E2Q96JD6 320 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 GINS3Q9BRX5 216 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 OR51M1Q9H341 326 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SGK494L7N484 410 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TGM5O43548 720 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF91Q05481 1191 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 LY6KQ17RY6 165 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM191AQ9H0A3 160 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 I6L893 689 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ORM1P02763 201 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF85Q03923 595 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 CLEC1AQ8NC01 280 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM239Q8WW34 195 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 TMED6Q8WW62 240 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 UNCXA6NJT0 531 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 NRP1O14786 923 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PPP1R3DO95685 299 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF17P17021 662 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 COX5AP20674 150 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 GHRHRQ02643 423 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ATP6V1FQ16864 119 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 SLC16A14Q7RTX9 510 aa11.63□□□□□ -0.55
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF429Q86V71 674 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms