RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa16.1■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 MDP1Q86V88 176 aa16.1■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 C20orf196Q8IYI0 205 aa16.1■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa16.1■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 ANKK1Q8NFD2 765 aa16.1■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 GPR32P1Q8NGA4 272 aa16.1■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 ANKRD27Q96NW4 1050 aa16.1■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 EPYCQ99645 322 aa16.1■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 CGREF1Q99674 301 aa16.1■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 MCHR1Q99705 422 aa16.1■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 ASPNQ9BXN1 380 aa16.1■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 NDUFAF1Q9Y375 327 aa16.1■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 SLC35F4A4IF30 521 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 M0QX08 132 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 IGHV4-31P0DP07 118 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 USF1P22415 310 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 THBS4P35443 961 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 PDLIM4P50479 330 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 VLDLRP98155 873 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 GGTLC2Q14390 218 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 C3orf36Q3SXR2 165 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 FAM169BQ8N8A8 192 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 C11orf65Q8NCR3 313 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 OR4D11Q8NGI4 311 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 OR6S1Q8NH40 331 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 PROX1Q92786 737 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 MAGEB18Q96M61 343 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 ARHGDIGQ99819 225 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 RABEP2Q9H5N1 569 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 NPHS2Q9NP85 383 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 CORINQ9Y5Q5 1042 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa16.09■□□□□ 0.17
CLK1-211ENST00000481641 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 VWC2LB2RUY7 222 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 B9A039 149 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 PLPP3O14495 311 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 ANGPT2O15123 496 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 HLA-HP01893 362 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 THY1P04216 161 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 CSF3P09919 207 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 AHCYP23526 432 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 PAX7P23759 505 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 PUDPQ08623 228 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 CAMK2DQ13557 499 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 MFSD13AQ14CX5 517 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 CHRFAM7AQ494W8 412 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 WDR88Q6ZMY6 472 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 DPP10Q8N608 796 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 OR4F15Q8NGB8 312 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 OR6T1Q8NGN1 323 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 FOXN4Q96NZ1 517 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 KCNK17Q96T54 332 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 TMEM43Q9BTV4 400 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 PLK3Q9H4B4 646 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 NOX3Q9HBY0 568 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 FKBP7Q9Y680 259 aa16.08■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 MXRA5Q9NR99 2828 aa16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 C11orf98E9PRG8 122 aa16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 LYPD3O95274 346 aa16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 PIGFQ07326 219 aa16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 NFYCQ13952 458 aa16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 EFNB3Q15768 340 aa16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 ENTPD8Q5MY95 495 aa16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 CYB5R2Q6BCY4 276 aa16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 LINC00114Q6XXX2 140 aa16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 SVOPLQ8N434 492 aa16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 SCAIQ8N9R8 606 aa16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 NUP37Q8NFH4 326 aa16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 MS4A3Q96HJ5 214 aa16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 B3GNT2Q9NY97 397 aa16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 A0A0G2JND7 137 aa16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 TMEM129A0AVI4 362 aa16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 SH3PXD2BA1X283 911 aa16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 hCG_2039718K7EN88 272 aa16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 EDF1O60869 148 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 PDE5AO76074 875 aa16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 CD79AP11912 226 aa16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 ARR3P36575 388 aa16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 NR4A2P43354 598 aa16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 RBBP4Q09028 425 aa16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 KRT80Q6KB66 452 aa16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 ZNF613Q6PF04 617 aa16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 ZNF813Q6ZN06 617 aa16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 HDXQ7Z353 690 aa16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 SPATA21Q7Z572 469 aa16.06■□□□□ 0.16
CLK1-211ENST00000481641 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms