RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 LRP5LA4QPB2 252 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM172BPA6NC97 362 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 IGLON5A6NGN9 336 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 HHLA1C9JL84 531 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 MSH4O15457 936 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 TPST2O60704 377 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 NOL4O94818 638 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 TSPAN12O95859 305 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 CISD3P0C7P0 127 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 POU2F1P14859 743 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 CD82P27701 267 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 PDHA2P29803 388 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 CCKARP32238 428 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 MMP12P39900 470 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 STK19P49842 368 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 IST1P53990 364 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 ENPEPQ07075 957 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 SSX2Q16385 188 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 CYBRD1Q53TN4 286 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 CTSL3PQ5NE16 218 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 SEL1L2Q5TEA6 688 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 C3P1Q6ZMU1 363 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC80Q76M96 950 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 RUFY3Q7L099 469 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 DHDDSQ86SQ9 333 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 CARM1Q86X55 608 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 OR52B6Q8NGF0 335 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 OR5L2Q8NGL0 311 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 OR1L4Q8NGR5 311 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 NABP1Q96AH0 204 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 TADA1Q96BN2 335 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 C7orf34Q96L11 122 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 CEP170P1Q96L14 293 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 FOXC2Q99958 501 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 C19orf43Q9BQ61 176 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 TRPM6Q9BX84 2022 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF556Q9HAH1 456 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 POLE4Q9NR33 117 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 SPHK2Q9NRA0 654 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC17A5Q9NRA2 495 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 PSME2Q9UL46 239 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 ZANQ9Y493 2812 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 CPQQ9Y646 472 aa4.59□□□□□ -1.67
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A075B6Q4 140 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A0D9SFI3 127 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 EDIL3O43854 480 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 NEMFO60524 1076 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 UPK3AO75631 287 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 SCGNO76038 276 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 PLEKHA8P1O95397 391 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 AGTP01019 485 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ALOX5P09917 674 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 PATE4P0C8F1 98 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 T-ENOLP0DO92 83 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 CALM1P0DP23 149 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 CALM2P0DP24 149 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 CALM3P0DP25 149 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 GNB3P16520 340 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 CDH4P55283 916 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 DLX5P56178 289 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ERVK-16P61578 105 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC7A9P82251 487 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 TLE4Q04727 773 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF33BQ06732 778 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 RGS1Q08116 209 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGAP19Q14CB8 494 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 SFT2D3Q587I9 215 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 OR2A2Q6IF42 318 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ARMCX5Q6P1M9 558 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 DOK6Q6PKX4 331 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 CLEC2AQ6UVW9 174 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 FRRS1Q6ZNA5 592 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF781Q8N8C0 355 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC148Q8NFR7 591 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 SPPL2BQ8TCT7 592 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 SERAC1Q96JX3 654 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC38A2Q96QD8 506 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM173AQ9BQD7 235 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC39A3Q9BRY0 314 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 FEM1AQ9BSK4 669 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 CLEC7AQ9BXN2 247 aa4.58□□□□□ -1.68
STRADBP1-201ENST00000478954 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms