RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF13O43567 381 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SERPINI2O75830 405 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 IGF2P01344 180 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF83P51522 516 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PRPS1P60891 318 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 MXRA7P84157 204 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 HIKESHIQ53FT3 197 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAM5Q6NVV9 412 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 KLHL17Q6TDP4 642 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 C16orf89Q6UX73 402 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SPNS3Q6ZMD2 512 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 C20orf204Q6ZNR8 217 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 C20orf196Q8IYI0 205 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM123Q8N131 208 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKK1Q8NFD2 765 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 OR1K1Q8NGR3 316 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PIGTQ969N2 578 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 LRR1Q96L50 414 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 GORASP2Q9H8Y8 452 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR35Q9HC97 309 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 C20orf141Q9NUB4 165 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 NDE1Q9NXR1 346 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 AMDHD2Q9Y303 409 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 M0R3G1 203 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 HS3ST1O14792 307 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 OR7A10O76100 309 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 HSD17B1P14061 328 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNGR1P15260 489 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 FUT4P22083 530 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXC12P31275 282 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PHYHD1Q5SRE7 291 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM108Q6UXF1 575 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 WDFY1Q8IWB7 410 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB107AQ8IZN7 70 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ALPK1Q96QP1 1244 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CRLF2Q9HC73 371 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PRR14LQ5THK1 2151 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 B2RBV5 119 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 M0R1B8 84 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 WNT11O96014 354 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ARF1P84077 181 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CAMK2DQ13557 499 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAM2Q15035 370 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 TBRG1Q3YBR2 411 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD16Q6P6B7 361 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC35D2Q76EJ3 337 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF611Q8N823 705 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 LIPHQ8WWY8 451 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 NEUROG1Q92886 237 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CCL19Q99731 98 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A096LPE4 126 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PPZ6 126 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCD4O14678 606 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PTAFRP25105 342 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CD40P25942 277 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 BIDP55957 195 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 FXNQ16595 210 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CEACAM16Q2WEN9 425 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 KLHL24Q6TFL4 600 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 OFCC1Q8IZS5 231 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 OR6X1Q8NH79 312 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 RADILQ96JH8 1075 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PIP5K1AQ99755 562 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 OBP2BQ9NPH6 170 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 MGAT4BQ9UQ53 548 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ENPP4Q9Y6X5 453 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 HTR3EA5X5Y0 456 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PIP5K1CO60331 668 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PRSS23O95084 383 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 LAPTM4AQ15012 233 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATS1Q496A3 300 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP4Z1Q86W10 505 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 KBTBD8Q8NFY9 601 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 OR6N1Q8NGY5 312 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 BPIFA2Q96DR5 249 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms