RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365359.1

RNU6-1138P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1138, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1138P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1138P-201ENST00000365359 STACQ99469 402 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ECSITQ9BQ95 431 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 POPDC2Q9HBU9 364 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HMG20AQ9NP66 347 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CALYQ9NYX4 217 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 XCL2Q9UBD3 114 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MMP17Q9ULZ9 603 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 B9D1Q9UPM9 204 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 WDR62O43379 1518 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SCN1AP35498 2009 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 C3orf84H3BNL1 204 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LRATO95237 230 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IGLV6-57P01721 117 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FABP3P05413 133 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IGKV1-13P0DP09 117 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FUT1P19526 365 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PRRX1P54821 245 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NUCB2P80303 420 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ARF5P84085 180 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IL1RL1Q01638 556 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 POU2AF1Q16633 256 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SLC25A52Q3SY17 297 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GGTA1PQ4G0N0 100 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CARD16Q5EG05 197 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZFP1Q6P2D0 407 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 KCNIP4Q6PIL6 250 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SMARCD3Q6STE5 483 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZNF493Q6ZR52 646 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ADM2Q7Z4H4 148 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LRRC43Q8N309 656 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ACOT4Q8N9L9 421 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 Q8NDZ9 215 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LINC01560Q8TB33 94 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HTR3CQ8WXA8 447 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MYLPFQ96A32 169 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CREB3L1Q96BA8 519 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TM4SF18Q96CE8 201 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ATG10Q9H0Y0 220 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RBKSQ9H477 322 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ECT2Q9H8V3 914 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MEAF6Q9HAF1 191 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IL26Q9NPH9 171 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SLC17A5Q9NRA2 495 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GLRX2Q9NS18 164 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NUDT15Q9NV35 164 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 KLHL28Q9NXS3 571 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 AIPL1Q9NZN9 384 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GNG12Q9UBI6 72 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PSG8Q9UQ74 426 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SIGLEC7Q9Y286 467 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PTPRTO14522 1441 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 A0A1B0GVI7 797 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OVOL1O14753 267 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 LANCL1O43813 399 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PFKFB2O60825 505 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 KERAO60938 352 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RP2O75695 350 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NEBLO76041 1014 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR4F21O95013 312 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MT-ATP6P00846 226 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TGFAP01135 160 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 APCSP02743 223 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 COX5AP20674 150 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CMA1P23946 247 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 KIF5BP33176 963 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RDXP35241 583 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ADRA1AP35348 466 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TGFBR2P37173 567 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NAMPTP43490 491 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CSNK1A1P48729 337 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PLA2G16P53816 162 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NAPAP54920 295 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RPS21P63220 83 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TNFRSF9Q07011 255 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IFT88Q13099 833 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZNF235Q14590 738 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GINS1Q14691 196 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PON3Q15166 354 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 BEND3Q5T5X7 828 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NIPAL3Q6P499 406 aa0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms