RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 BIDP55957 195 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 RAB38P57729 211 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 OR4Q3Q8NH05 313 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 DUSP13Q9UII6 198 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 USP22Q9UPT9 525 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 MYO10Q9HD67 2058 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 FABP7O15540 132 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 KCNK5O95279 499 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ABHD16AO95870 558 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 HES1Q14469 280 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 GAREM2Q75VX8 874 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 LRFN5Q96NI6 719 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 MOKQ9UQ07 419 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 CLEC14AQ86T13 490 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ZNF595Q8IYB9 648 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 DECR2Q9NUI1 292 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 F6UZH7 168 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 DEFA4P12838 97 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 DAPP51397 102 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 PLK5Q496M5 336 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SLC6A18Q96N87 628 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 C4BP0C0L5 1744 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 HSD17B6O14756 317 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 CER1O95813 267 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 F10P00742 488 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 OR2T7P0C7T2 308 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 TNFRSF17Q02223 184 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 HTR3DQ70Z44 454 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 OR2T27Q8NH04 317 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 NAT6Q93015 286 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 RNF170Q96K19 258 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 FIZ1Q96SL8 496 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 GNB4Q9HAV0 340 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ALPLP05186 524 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 C1SP09871 688 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 AADACP22760 399 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SLC7A9P82251 487 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 Q499Y3 187 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ABHD4Q8TB40 342 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 RNF141Q8WVD5 230 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 PBX4Q9BYU1 374 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 WDR76Q9H967 626 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SERINC4A6NH21 518 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ZNF732B4DXR9 585 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 CPT2P23786 658 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SSR4P51571 173 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 HTR4Q13639 388 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ADIPOR2Q86V24 386 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 CPXM2Q8N436 756 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ABHD6Q9BV23 337 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 OLFM2O95897 454 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SRPXP78539 464 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 DEFB103AP81534 67 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SCCPDHQ8NBX0 429 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 FGF13Q92913 245 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 RAB19A4D1S5 217 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ADAM23O75077 832 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SLC35A1P78382 337 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 AVPI1Q5T686 147 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 FRMD1Q8N878 549 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 PXT1Q8NFP0 134 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 MED17Q9NVC6 651 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 LRIT2A6NDA9 550 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SMLR1H3BR10 107 aa14.87□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 MTHFD2P13995 350 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms