RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PRD5 423 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PRF3 423 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PRM7 423 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PS29 197 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CLDN24A6NM45 220 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 H0YAE9 185 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 EPPINO95925 133 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 HCKP08631 526 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FCGR1AP12314 374 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TNFRSF1AP19438 455 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 KDELR2P33947 212 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ADAM8P78325 824 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 LAPTM4AQ15012 233 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 P2RY6Q15077 328 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GSG1Q2KHT4 349 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MUC15Q8N387 334 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 OR2T4Q8NH00 348 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ALPK1Q96QP1 1244 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CKLFQ9UBR5 152 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 C1QL1O75973 258 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFB2O95178 105 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 QDPRP09417 244 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ACP2P11117 423 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF35P13682 527 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 IL12AP29459 219 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CRABP1P29762 137 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RGS6P49758 472 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0040Q15053 153 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 NTRK2Q16620 822 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PAGE3Q5JUK9 113 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PODNL1Q6PEZ8 512 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CBLN3Q6UW01 205 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL36Q8N4N3 616 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 YIPF7Q8N8F6 280 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 IL17RDQ8NFM7 739 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ELP5Q8TE02 316 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF721Q8TF20 911 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 HSH2DQ96JZ2 352 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TAAR6Q96RI8 345 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PIMREGQ9BSJ6 248 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MROQ9BYG7 248 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ACER3Q9NUN7 267 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 OSGIN1Q9UJX0 560 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MGAT4BQ9UQ53 548 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CCL27Q9Y4X3 112 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FN1P02751 2386 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TVP23AA6NH52 213 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ALG1L2C9J202 215 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 H7C1C5 153 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FBP2O00757 339 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MYL12BO14950 172 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GCGRP47871 477 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PDLIM4P50479 330 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGDIBP52566 201 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 LCN6P62502 163 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CSNK2BP67870 215 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 HES1Q14469 280 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ESCO2Q56NI9 601 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 BTNL3Q6UXE8 466 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PGAP1Q75T13 922 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SYNPRQ8TBG9 265 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FANK1Q8TC84 345 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 NPRL2Q8WTW4 380 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TSPEARQ8WU66 669 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 C22orf15Q8WYQ4 148 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FAM168AQ92567 244 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 UCN2Q96RP3 112 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TAAR3PQ9P1P4 343 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 VCANP13611 3396 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0J9YW62 118 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 DHRS12A0PJE2 317 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms