RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262304.8

PKD1-201, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKD1, Length 14,138 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-201ENST00000262304 SPINK4O60575 86 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 FCGR2AP12318 317 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 LBX1P52954 281 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 LTB4RQ15722 352 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SLC35B2Q8TB61 432 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 RANBP9Q96S59 729 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ATF6BQ99941 703 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 LDB3O75112 727 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 NFYBP25208 207 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 H3F3CQ6NXT2 135 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SIMC1Q8NDZ2 872 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ZFAND1Q8TCF1 268 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ROS1P08922 2347 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 CA14Q9ULX7 337 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 FAM69AQ5T7M9 428 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 MFSD9Q8NBP5 474 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 OR2T11Q8NH01 316 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 IRF7Q92985 503 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 PLSCR3Q9NRY6 295 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ARSDP51689 593 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 RAP2BP61225 183 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 COMMD6Q7Z4G1 85 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 C17orf78Q8N4C9 275 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 CHFRQ96EP1 664 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 RNF150Q9ULK6 438 aa9.5□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 H3BVH4 76 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 DDOQ99489 341 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SLC30A3Q99726 388 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SOD2P04179 222 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 HPNP05981 417 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SELPLGQ14242 412 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 PSMF1Q92530 271 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 RAB39BQ96DA2 213 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 GMLQ99445 158 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 LIPT1Q9Y234 373 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 OR4N2Q8NGD1 307 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 GABRB3P28472 473 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 KCNJ15Q99712 375 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 A0A0B4J203 849 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 METTL15A6NJ78 407 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 OR5I1Q13606 314 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 OR2T2Q6IF00 324 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 G3V3Q6 166 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 FABP4P15090 132 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ELK1P19419 428 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 GALNT2Q10471 571 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 BLNKQ8WV28 456 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 MUL1Q969V5 352 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 NAP1L6A6NFF2 107 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SLC6A12P48065 614 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 TNFRSF17Q02223 184 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 KCNC3Q14003 757 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 IGSF21Q96ID5 467 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 CSAG2Q9Y5P2 127 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 CDHR4A6H8M9 788 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 CBR3O75828 277 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 HBG1P69891 147 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 HBG2P69892 147 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 TIFABQ6ZNK6 161 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 VEGFDO43915 354 aa9.49□□□□□ -0.89
PKD1-201ENST00000262304 SLC16A7O60669 478 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms