RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613995.4

PDE4DIP-240, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 5

Gene PDE4DIP, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-240ENST00000613995 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 USP22Q9UPT9 525 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 GMEB1Q9Y692 573 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 MED13LQ71F56 2210 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 HIVEP1P15822 2718 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 A0A1B0GWA3 101 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 TMEM72A0PK05 275 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 M0R3H8 397 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 SYT5O00445 386 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 FAAHO00519 579 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 GSTA4O15217 222 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 TIPRLO75663 272 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRKD3O94806 890 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 MFN2O95140 757 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 CRHP06850 196 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRF1P14222 555 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 PTNP21246 168 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRKAR1BP31321 381 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 KIR2DL3P43628 341 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 GZMMP51124 257 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 RAC3P60763 192 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 RBBP4Q09028 425 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 DUSP7Q16829 419 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 TMPPEQ6ZT21 453 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 FCRLAQ7L513 359 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 PIGWQ7Z7B1 504 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 CALHM3Q86XJ0 350 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 P3H2Q8IVL5 708 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLC30A8Q8IWU4 369 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF610Q8N9Z0 462 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 OR8J3Q8NGG0 315 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 OR52E4Q8NGH9 312 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLC26A7Q8TE54 656 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 TAMM41Q96BW9 452 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 DDIT4LQ96D03 193 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 CMTM5Q96DZ9 223 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF583Q96ND8 569 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 CCT8L2Q96SF2 557 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 SYT3Q9BQG1 590 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 WFDC6Q9BQY6 131 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF559Q9BR84 538 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 ENKD1Q9H0I2 346 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 MYLK2Q9H1R3 596 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 PIGMQ9H3S5 423 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 EFCAB1Q9HAE3 211 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 ADPRHL2Q9NX46 363 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 KLHL28Q9NXS3 571 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 GALNT8Q9NY28 637 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 SELENONQ9NZV5 590 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 PROCRQ9UNN8 238 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 TUBAL3A6NHL2 446 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 A8MXE2 369 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 FAM220BPB1ANY3 271 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 NME4O00746 187 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF208O43345 1280 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 RAMP1O60894 148 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 TMEM127O75204 238 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 DCTN3O75935 186 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 PMS2P2O95744 297 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 LGI1O95970 557 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 YES1P07947 543 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 POU2F1P14859 743 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 IGFBP2P18065 325 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 TNFRSF1BP20333 461 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 FPR1P21462 350 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 HTR2AP28223 471 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 AGTR1P30556 359 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 IDUAP35475 653 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLC7A2P52569 658 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 PSME3P61289 254 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLC35A1P78382 337 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 MXRA7P84157 204 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 TLE4Q04727 773 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 LIPEQ05469 1076 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 FAM27E3Q08E93 113 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4DIP-240ENST00000613995 CEACAM7Q14002 265 aa4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms