RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 MOGAT1Q96PD6 335 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 PIP5K1AQ99755 562 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 TMEM204Q9BSN7 226 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 CXXC4Q9H2H0 198 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 NANSQ9NR45 359 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 ADA2Q9NZK5 511 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 B3GAT1Q9P2W7 334 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 MGAT4BQ9UQ53 548 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 NOX1Q9Y5S8 564 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 SLC25A15Q9Y619 301 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 TACC2O95359 2948 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 CSMD2Q7Z408 3487 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 A0A1W2PR80 420 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 LRRN3E7EW58 273 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 C11orf98E9PRG8 122 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 M0R1B8 84 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 PLPP3O14495 311 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 ARHGEF9O43307 516 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 CH25HO95992 272 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 PLAUP00749 431 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 SERPINA1P01009 418 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 THY1P04216 161 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 PAX7P23759 505 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 CDH11P55287 796 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 PRPS1P60891 318 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 LTBQ06643 244 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 ST3GAL3Q11203 375 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 ZNF74Q16587 644 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 IFI44LQ53G44 452 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 ADAM5Q6NVV9 412 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 WDR88Q6ZMY6 472 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 FKBP9P1Q75LS8 142 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 ZNF611Q8N823 705 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 ANKK1Q8NFD2 765 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 KBTBD8Q8NFY9 601 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 OR1K1Q8NGR3 316 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 FBXW5Q969U6 566 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 PRRC1Q96M27 445 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 CXorf56Q9H5V9 222 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 OBP2BQ9NPH6 170 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 SLC17A5Q9NRA2 495 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 NDE1Q9NXR1 346 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 ABCD2Q9UBJ2 740 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 TAGLN3Q9UI15 199 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 RIMS3Q9UJD0 308 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 ZNF229Q9UJW7 825 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 RPS6KA6Q9UK32 745 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 POU2F3Q9UKI9 436 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 MED31Q9Y3C7 131 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-204ENST00000578208 DPRXA6NFQ7 191 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 MS4A18H0YCH9 400 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 ABCD4O14678 606 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 RNF13O43567 381 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 TMCC2O75069 709 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 UPK3AO75631 287 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 ZNF432O94892 652 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 LYPD3O95274 346 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 HPRP00739 348 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 PTAFRP25105 342 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 MS4A18Q3C1V0 323 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 TBRG1Q3YBR2 411 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 CARD17Q5XLA6 110 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 C16orf89Q6UX73 402 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 CBLL1Q75N03 491 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 PXKQ7Z7A4 578 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 PIGWQ7Z7B1 504 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 CYP4Z1Q86W10 505 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 OR6N1Q8NGY5 312 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 TMEM255BQ8WV15 326 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 TMEM239Q8WW34 195 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 SGTBQ96EQ0 304 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 RADILQ96JH8 1075 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 HSH2DQ96JZ2 352 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 OR2M2Q96R28 347 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 PRSS27Q9BQR3 290 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 ZNF426Q9BUY5 554 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 FNDC11Q9BVV2 318 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 FAIMQ9NVQ4 179 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 NPAP1Q9NZP6 1156 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 SLC35F4A4IF30 521 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 M0R3G1 203 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 MT-ND1P03886 318 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 HLA-DOBP13765 273 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 NCK1P16333 377 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 MNAT1P51948 309 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 UGT2B15P54855 530 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-204ENST00000578208 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms