RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562291.2

INO80E-204, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-204ENST00000562291 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.46□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.46□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 GPR35Q9HC97 309 aa8.46□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.46□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.46□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
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INO80E-204ENST00000562291 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.46□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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INO80E-204ENST00000562291 OPN1SWP03999 348 aa8.45□□□□□ -1.06
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INO80E-204ENST00000562291 PPP2R2BQ00005 443 aa8.45□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.062e-6■■■□□ 16.5
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INO80E-204ENST00000562291 CARD17Q5XLA6 110 aa8.45□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.45□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 ANKRD16Q6P6B7 361 aa8.45□□□□□ -1.06
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INO80E-204ENST00000562291 PIK3C3Q8NEB9 887 aa8.45□□□□□ -1.06
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INO80E-204ENST00000562291 SH3GL1Q99961 368 aa8.45□□□□□ -1.06
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INO80E-204ENST00000562291 NANOGQ9H9S0 305 aa8.45□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.45□□□□□ -1.06
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INO80E-204ENST00000562291 PLCE1Q9P212 2302 aa8.45□□□□□ -1.06
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INO80E-204ENST00000562291 TUBA1AQ71U36 451 aa8.44□□□□□ -1.06
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INO80E-204ENST00000562291 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.44□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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INO80E-204ENST00000562291 TXNDC15Q96J42 360 aa8.44□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 OR2M2Q96R28 347 aa8.44□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 ARHGDIGQ99819 225 aa8.44□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 TMEM43Q9BTV4 400 aa8.44□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 EMC6Q9BV81 110 aa8.44□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 CRLF2Q9HC73 371 aa8.44□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa8.44□□□□□ -1.06
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INO80E-204ENST00000562291 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.44□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 NOX1Q9Y5S8 564 aa8.44□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 HIVEP2P31629 2446 aa8.43□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.43□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 SLC35F4A4IF30 521 aa8.43□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.43□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 LRRN3E7EW58 273 aa8.43□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 C11orf98E9PRG8 122 aa8.43□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.43□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 PLPP3O14495 311 aa8.43□□□□□ -1.06
INO80E-204ENST00000562291 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
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