RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 CD79AP11912 226 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CPA3P15088 417 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 B4GALT1P15291 398 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 IL12AP29459 219 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ALDH3A1P30838 453 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RPS5P46782 204 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CAPZA2P47755 286 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 LIMS1P48059 325 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 GIPRP48546 466 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CLK1P49759 484 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 FOXL1Q12952 345 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MS4A18Q3C1V0 323 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF311Q5JNZ3 666 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 DCAF12L2Q5VW00 463 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SAXO2Q658L1 398 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ACSM5Q6NUN0 579 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF836Q6ZNA1 936 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 Q6ZPA2 131 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 C16orf62Q7Z3J2 963 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SERPINA11Q86U17 422 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SKA3Q8IX90 412 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 C4orf33Q8N1A6 199 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 BPIFB2Q8N4F0 458 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MIPOL1Q8TD10 442 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 WFDC12Q8WWY7 111 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TAAR8Q969N4 342 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC25A36Q96CQ1 311 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 KCNS3Q9BQ31 491 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SUCNR1Q9BXA5 334 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TNFRSF19Q9NS68 423 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TAAR3PQ9P1P4 343 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC17A7Q9P2U7 560 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 NFU1Q9UMS0 254 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 M0R082 166 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ITM2AO43736 263 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC43A1O75387 559 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 BCL10O95999 233 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 GPIP06744 558 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 VSIG8P0DPA2 414 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 THRBP10828 461 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PCGF2P35227 344 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 GLRXP35754 106 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 HPCAL1P37235 193 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MPV17P39210 176 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MVDP53602 400 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 NME5P56597 212 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM33P57088 247 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 BAMBIQ13145 260 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MFSD13AQ14CX5 517 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TSTQ16762 297 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 GTDC1Q4AE62 458 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 GPAT3Q53EU6 434 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ATG16L1Q676U5 607 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM225Q6GV28 225 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 C8orf74Q6P047 294 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RNF165Q6ZSG1 346 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 USP51Q70EK9 711 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RNF130Q86XS8 419 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CADM2Q8N3J6 435 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 OR4A15Q8NGL6 344 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TMIGD2Q96BF3 282 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ZBTB9Q96C00 473 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 DDIT4LQ96D03 193 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKRD27Q96NW4 1050 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 FMO2Q99518 471 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 LINC00470Q9BZP3 86 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 C20orf27Q9GZN8 174 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MED29Q9NX70 200 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PCDHGB4Q9UN71 923 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.72□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 A0A0G2JMP0 313 aa5.72□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 A0A0X1KG70 313 aa5.72□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CDHR4A6H8M9 788 aa5.72□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CFAP73A6NFT4 308 aa5.72□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa5.72□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SMIM23A6NLE4 172 aa5.72□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 C17orf100A8MU93 164 aa5.72□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 G3V4G9 280 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms