RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 TOR3AQ9H497 397 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-220ENST00000550700 RIBC2Q9H4K1 309 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-220ENST00000550700 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-220ENST00000550700 ASF1BQ9NVP2 202 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-220ENST00000550700 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-220ENST00000550700 TAS2R5Q9NYW4 299 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-220ENST00000550700 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-220ENST00000550700 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-220ENST00000550700 KLHL21Q9UJP4 597 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-220ENST00000550700 LIPGQ9Y5X9 500 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-220ENST00000550700 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SVILO95425 2214 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ZNF726A6NNF4 738 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 RIIAD1A6NNX1 92 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ZAR1LA6NP61 321 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MS4A18H0YCH9 400 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 XKRYO14609 159 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 AKR7A3O95154 331 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SNAP29O95721 258 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TXNDC12O95881 172 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 BCL10O95999 233 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ACADSP16219 412 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PAICSP22234 425 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 POU1F1P28069 291 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SHC1P29353 583 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 AQP2P41181 271 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CTXN1P60606 82 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CSNK2BP67870 215 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 HSF1Q00613 529 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MYBPC1Q00872 1141 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CACNA1BQ00975 2339 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TEKQ02763 1124 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 GINS1Q14691 196 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MS4A18Q3C1V0 323 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 GXYLT1Q4G148 440 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MEDAGQ5VYS4 303 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TMEM211Q6ICI0 200 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 LRRC17Q8N6Y2 441 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TMEM99Q8N816 258 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 RNF128Q8TEB7 428 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TFAP2CQ92754 450 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SAMD8Q96LT4 415 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 Q96MT0 163 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ZNF570Q96NI8 536 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PITX2Q99697 317 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 GPA33Q99795 319 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MCCC2Q9HCC0 563 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 LUZP4Q9P127 313 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 RCE1Q9Y256 329 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ITPR1Q14643 2758 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CLCA1A8K7I4 914 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MCIDASD6RGH6 385 aa8.32□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 WISP1O95388 367 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 OPN1LWP04000 364 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TPOP07202 933 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 YES1P07947 543 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ZNF3P17036 446 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ACVR2AP27037 513 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SDHAP31040 664 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TIMP3P35625 211 aa8.32□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 BLVRAP53004 296 aa8.32□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 RPL27P61353 136 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 NFATC3Q12968 1075 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ITGADQ13349 1161 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 FHL1Q13642 323 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SLC17A1Q14916 467 aa8.32□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 PGGHGQ32M88 737 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PCSK4Q6UW60 755 aa8.32□□□□□ -1.08
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