RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARPC3O15145 178 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRKYO43930 277 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAMP1O60894 148 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC2A10O95528 541 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HLA-DOBP13765 273 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFNGR1P15260 489 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABOP16442 354 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF43P17038 809 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYF6P23409 242 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACVR2AP27037 513 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACVR1BP36896 505 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCYT1AP49585 367 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 P2RY4P51582 365 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H3F3AP84243 136 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDK3Q15120 406 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PON3Q15166 354 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.192e-6■■■■□ 23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACKR1Q16570 336 aa7.6□□□□□ -1.19
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GFRALQ6UXV0 394 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP51Q70EK9 711 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC35D2Q76EJ3 337 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR9K2Q8NGE7 335 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RASD2Q96D21 266 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WBP1Q96G27 269 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TXNDC15Q96J42 360 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q96M85 177 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIB1Q96RU8 372 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLN6Q9NWW5 311 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AASSQ9UDR5 926 aa7.6□□□□□ -1.19
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF6Q9Y252 685 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR52Q9Y2T5 361 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MED13Q9UHV7 2174 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 APC2O95996 2303 aa7.6□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.59□□□□□ -1.19
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PNV4 684 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A6NIZ1 184 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC22A20A6NK97 555 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AHRRA9YTQ3 701 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 E9PQ18 207 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SURF4O15260 269 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARHGEF9O43307 516 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MPZL2O60487 215 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYTIPO60759 359 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FZD7O75084 574 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RENP00797 406 aa7.59□□□□□ -1.19
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF3P17036 446 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PAICSP22234 425 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SDHAP31040 664 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BIDP55957 195 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLDN17P56750 224 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAP1BP61224 184 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ISL1P61371 349 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAP1AP62834 184 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD47Q08722 323 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NFATC3Q12968 1075 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MELKQ14680 651 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EMC4Q5J8M3 183 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCSK4Q6UW60 755 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
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