RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DSCR9P59020 149 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP2R2BQ00005 443 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LGALS3BPQ08380 585 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DUSP7Q16829 419 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 B3GLCTQ6Y288 498 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UEVLDQ8IX04 471 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC36Q8IYA8 594 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPR137CQ8N3F9 429 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMYD1Q8NB12 490 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC38A2Q96QD8 506 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MCHR1Q99705 422 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNS3Q9BQ31 491 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RHNO1Q9BSD3 238 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CACNG6Q9BXT2 260 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SEC14L4Q9UDX3 406 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MOKQ9UQ07 419 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCA2Q9BZC7 2435 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLCE1Q9P212 2302 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MS4A18H0YCH9 400 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H7C417 338 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NDUFS7O75251 213 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SASH3O75995 380 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MT-ATP6P00846 226 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NPPAP01160 153 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRYAAP02489 173 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VIMP08670 466 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCGF2P35227 344 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUDT6P53370 316 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IL1RL1Q01638 556 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PMS2P3Q13401 168 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MS4A18Q3C1V0 323 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINGO2Q7L985 606 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC26A7Q8TE54 656 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RASSF5Q8WWW0 418 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRR1Q96L50 414 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR2M2Q96R28 347 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGDIGQ99819 225 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KATNB1Q9BVA0 655 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPR35Q9HC97 309 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NOX1Q9Y5S8 564 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TLN2Q9Y4G6 2542 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VPS13CQ709C8 3753 aa13.21□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FN1P02751 2386 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHP2O43745 196 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SSX4O60224 188 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BGLAPP02818 100 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CBLP22681 906 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARF1P84077 181 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SELPLGQ14242 412 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COQ5Q5HYK3 327 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NANOGP8Q6NSW7 305 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC00114Q6XXX2 140 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PXKQ7Z7A4 578 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C10orf53Q8N6V4 93 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPR32P1Q8NGA4 272 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR10A6Q8NH74 314 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WFDC6Q9BQY6 131 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NANOGQ9H9S0 305 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRLF2Q9HC73 371 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZANQ9Y493 2812 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A096LPE4 126 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A1W2PPZ6 126 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 M0R3H8 397 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBP2O00757 339 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGLV1-44P01699 117 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OPN1SWP03999 348 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TP53P04637 393 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CBR1P16152 277 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCSK6P29122 969 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PUDPQ08623 228 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VMACQ2NL98 169 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEACAM16Q2WEN9 425 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLEC2AQ6UVW9 174 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC80Q76M96 950 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNX32Q86XE0 403 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C20orf196Q8IYI0 205 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM123Q8N131 208 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR10H5Q8NGA6 315 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR4F15Q8NGB8 312 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR8J3Q8NGG0 315 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR6T1Q8NGN1 323 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MPP4Q96JB8 637 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MOGAT1Q96PD6 335 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAPPC13A5PLN9 417 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF726A6NNF4 738 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BBIP1A8MTZ0 92 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VSTM5A8MXK1 200 aa13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms