RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 J3KTA2 159 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SIAH2O43255 324 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 KLF4O43474 513 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 PDE5AO76074 875 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 HRGP04196 525 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 THBDP07204 575 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF43P17038 809 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ITGA2P17301 1181 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 LIMS1P48059 325 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TLE4Q04727 773 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 FHL1Q13642 323 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM225Q6GV28 225 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 P2RY8Q86VZ1 359 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 S100PBPQ96BU1 408 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SGTBQ96EQ0 304 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 PIP5K1AQ99755 562 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MED18Q9BUE0 208 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 FNDC11Q9BVV2 318 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 RASSF1Q9NS23 344 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MED31Q9Y3C7 131 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A087WUU8 490 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR5H1A6NKK0 313 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 CENPBD1B2RD01 187 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 PIP5K1CO60331 668 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 LYZL6O75951 148 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 CH25HO95992 272 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADAP00813 363 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGHMP01871 453 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 FABP3P05413 133 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 HLA-DOBP13765 273 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 NQO1P15559 274 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 IL32P24001 234 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MPGP29372 298 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC9A3P48764 834 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SELENOPP49908 381 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRKCDQ05655 676 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 PMS2P3Q13401 168 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 GK3PQ14409 553 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF627Q7L945 461 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINGO2Q7L985 606 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 AAED1Q7RTV5 226 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 DHFR2Q86XF0 187 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 UEVLDQ8IX04 471 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 NRMQ8IXM6 262 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR6X1Q8NH79 312 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC01560Q8TB33 94 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 RNF217Q8TC41 542 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 BPIFA2Q96DR5 249 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 LRR1Q96L50 414 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 LURAP1Q96LR2 239 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRIM15Q9C019 465 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC3-206ENST00000469757 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms