RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 PTOV1Q86YD1 416 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SCAIQ8N9R8 606 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 RNF217Q8TC41 542 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SH3GL1Q99961 368 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ASPNQ9BXN1 380 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 NPHS2Q9NP85 383 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 MOKQ9UQ07 419 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 A0A0B4J2E0 115 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 A0A0G2JND7 137 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1B0GX12 115 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF726A6NNF4 738 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 H7C417 338 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 MT-ATP6P00846 226 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CRYAAP02489 173 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 BGLAPP02818 100 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CBR1P16152 277 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 PTNP21246 168 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 PCSK6P29122 969 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 AQP1P29972 269 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 EFNA4P52798 201 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 NUDT6P53370 316 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CDH12P55289 794 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 IL1RL1Q01638 556 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 LGALS3BPQ08380 585 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SPOCK1Q08629 439 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ZP4Q12836 540 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 PMS2P3Q13401 168 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 NFYCQ13952 458 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CYP51A1Q16850 503 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 MST1LQ2TV78 715 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC80Q76M96 950 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 LINGO2Q7L985 606 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 PXKQ7Z7A4 578 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 RETREG3Q86VR2 466 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 COMTD1Q86VU5 262 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SNX32Q86XE0 403 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 UEVLDQ8IX04 471 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SMYD1Q8NB12 490 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 OR2M2Q96R28 347 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 MCHR1Q99705 422 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ARHGDIGQ99819 225 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 NANOGQ9H9S0 305 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 GPR35Q9HC97 309 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ATRQ13535 2644 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.391e-7■■■□□ 15.5
PTPRF-210ENST00000463041 COL6A5A8TX70 2615 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 A0A096LPE4 126 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PPZ6 126 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 SLC35F4A4IF30 521 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 B9A039 149 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 INAFM1C9JVW0 142 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 PLPP3O14495 311 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 CHP2O43745 196 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRF-210ENST00000463041 PDE5AO76074 875 aa6.34□□□□□ -1.39
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